30G的芯片数据怎么下载呢
最近接到学徒求助，在广州，导师给了她分析cnv芯片的任务，调研文献发现，数据集很可怕，30G的芯片数据感觉下到猴年马月都不一定能成功！
我很少在中国大陆真正的下载数据并且处理，我打开https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE60607 发现的确是很大，通常呢，如果是表达矩阵，我会建议大家直接处理即可，忽略掉原始芯片数据。但是这个SNP6.0的CNV芯片不太一样，其实即使我为她下载了原始数据，基本上也很难教会其使用MATLAB去处理它！
如果你直接使用浏览器，下载，会发现，经常就会失败！
如果你听完我B站的GEO课，就知道，可以使用FTP服务器找到链接后下载：
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE60nnn/GSE60607/suppl/
有了链接， 如你是在海外，通常是下载速度10M/S已经绰绰有余，如果你是在中国大陆，可以尝试迅雷等下载神器。
因为我的确不熟悉中国大陆的下载方式，所以希望粉丝们可以帮忙看看！欢迎留言推举你喜欢的下载工具哦！
另外，号召学徒们都要向九月份杨胖子学习：
号外：生信技能树全国巡讲11月在福州和上海，点击了解报名哈：（福州、上海见！）全国巡讲第19-20站（生信入门课加量不加价）
如果你处理的并不是像这个学徒的CNV芯片，是常规的表达芯片，可以看公共数据库挖掘系列推文 ；
然后看B站的GEO数据挖掘技巧，基本上该分享的都在B站和GitHub了，目录如下：
第一讲：GEO，表达芯片与R
第二讲：从GEO下载数据得到表达量矩阵
第三讲：对表达量矩阵用GSEA软件做分析
第四讲：根据分组信息做差异分析
第五讲：对差异基因结果做GO/KEGG超几何分布检验富集分析
第六讲：指定基因分组boxplot指定基因list画热图
第七讲：根据差异基因list获取string数据库的PPI网络数据
第八讲：PPI网络数据用R或者cytoscape画网络图
第九讲：网络图的子网络获取
第十讲：hug genes如何找