Nat Genet|中科院昆明动物所科研人员大规模测序揭示了比目鱼基因组的特殊体型的多系起源特征

比目鱼的特殊身体结构的进化和遗传起源在很大程度上还不清楚。我们分析了胸鳍比目鱼14个科中的9个的11种比目鱼的基因组,得出的结论是胸鳍比目鱼和拟胸鳍比目鱼并没有形成一个单系群,表明它们的起源独立于不同的胸鳍比目鱼祖先。基因组和转录组数据表明,与WNT和维甲酸通路相关的基因、受阻的肌肉组织和减少的脂质可能在胸膜鱼特化身体结构的进化中发挥了作用。鳒亚目的进化涉及到相似但不完全相同的基因。我们的工作为理解比目鱼不同寻常的身体结构的遗传起源提供了宝贵的资源和见解。

图 本研究中测序的比目鱼物种的地理分布

Abstract:

The evolutionary and genetic origins of the specialized body plan of flatfish are largely unclear. We analyzed the genomes of 11 flatfish species representing 9 of the 14 Pleuronectiforme families and conclude that Pleuronectoidei and Psettodoidei do not form a monophyletic group, suggesting independent origins from different percoid ancestors.

Genomic and transcriptomic data indicate that genes related to WNT and retinoic acid pathways, hampered musculature and reduced lipids might have functioned in the evolution of the specialized body plan of Pleuronectoidei.

Evolution of Psettodoidei involved similar but not identical genes. Our work provides valuable resources and insights for understanding the genetic origins of the unusual body plan of flatfishes.

来源:

https://www.nature.com/articles/s41588-021-00836-9

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