科研新手会用到的Image J使用方法总结
之前我们也分享过很多这类的帖子,点击查看。
之前也讲过,点击查看。
选一张肺部的Masson三色染色图,染色结果为:胶原纤维呈蓝色(如光绿液染色为绿色),胞浆、肌肉、纤维素、神经胶质呈红色,胞核黑蓝色。对 Masson 染色的分析通常是计算胶原容积分数 (Collagenvolume fraction,CVF),即胶原阳性的蓝色面积与组织总面积的百分比。
1、打开 Imagej 软件,点击 File → Open 打开待分析 Masson 染色图片
2、在工具栏中选择Image按钮→选择Type→再选择RGBStack按钮,之后你的图片将会是以下这种显示情况
3、此时再将图片下方的调节滑轮拉到中间或是最右边,以获得最佳的对比度→再选择Image按钮→点击Adjust→点击Threshold按钮→出现的窗口如下:
4、此时只需要调节上下两个滑轮即可对图片的阳性染色面积进行标记
5、然后我们进入统计阶段→点击Analyze →然后Select Measurements按钮→出现窗口后再点击Area fraction按钮
6、点击Analyze按钮→点击measure,即可计算阳性面积百分比,图中8.289就是所要的数据
很抱歉,电脑中没有免疫荧光图片,基本上的操作步骤同上,只是在threshold这一步有点差别(借用一下上一个图片),如图所示:在threshold窗口中,将下方滑轮滑到最右边,上方滑轮可左右调节,调整最适合的视野,之后的计算步骤同上。
因为字数有限,所以只介绍了这几种,如果大家觉得有帮助的话,之后我会陆续整理出Image J应用于其他实验的具体操作步骤。希望对待大家有帮助。
赞 (0)