工欲善其事必先利其器--蛋白/RNA内参的选取
不知道从什么时候起,一提到内参,首先想到的就是GAPDH,或者β-Actin,如果还能说出Tubulin,那真是好不得意。
BuT,关于内参的选择,是否就这么简单呢?里面的一些弯弯绕绕,让美丽带大家来体会一下。
首先,内参不是万能的,不同的研究对象,可以选择的内参也不尽相同。
其次,以蛋白为例,内参尽量与目标蛋白的大小存在5kDa以上的出入,否则条带不好区分。
第三,不同分组间,尽量让内参蛋白表达量一致或近似,不要出现过多过少参差不齐的情况,如果不能避免,可以考虑重新调整内参,如果数值差距不多,可以考虑内参均一化处置。
第四,给大家提供一个表格,总结大部分常见、不常见内参的名字-适用条件-禁忌条件
β-Actin |
全细胞/胞质内参 |
不适合核提取物 |
GAPDH |
全细胞/胞质内参 |
不适合与氧相关的研究 |
α-Tubulin |
全细胞/胞质内参 |
不适合设计年龄差异较大的受试者研究 |
Lamin B1 |
核内参 |
不适合胚胎干细胞 |
COX IV |
线粒体内参 |
不适合15-17 kDa 蛋白 |
Transferrin |
血清内参 |
转铁蛋白水平可能受某些疾病状态和治疗影响,如维甲酸之类的药物 |
Histone H3 |
核内参 |
不适合15-17 kDa 蛋白 |
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