冤家不路窄，Illumina 与赛默飞世尔为何签署合作？保卫市场才是目的【J.P 摩根大会】
又是一年J.P 摩根大会。每年，诸多生物技术公司都会选择在会上宣布自家的重磅消息。Illumina也是如此，比如2014年的“千美元测序”、再比如2017年的NovaSeq。每年这家公司都能在大会期间掀起讨论热潮。
尽管Illumina尚未爆出万众期待已久的”百美元测序“产品，但在1月8日宣布的两条消息同样耐人寻味。
第一条是合作。Illumina和赛默飞世尔共同宣布签署了一项商业协议，该协议将许可Illumina将赛默飞世尔的Ion AmpliSeq技术销售给使用Illumina新一代测序（NGS）平台进行科学研究的科研人员。
Ion AmpliSeq拥有一种先进的扩增子技术，能够高效的从微量的样本中DNA和RNA，适用于科研和体外诊断等多个研究领域。
协议中强调，Illumina将获得Ion AmpliSeq的科研销售权，Illumina将以AmpliSeq for Illumina的名称将产品直接出售给客户。
赛默飞世尔将继续向Ion Torrent的NGS客户出售Ion AmpliSeq试剂供体外诊断（IVD）和科研（RUO）使用，并保留将该技术用于其他新一代测序平台的权利。
通过资源互换实现互利互赢，这种公司与公司之间的授权协议并不稀奇。但这两家公司的合作，倒是让人颇感意外。
Illumina、赛默飞世尔都是测序设备市场的巨头，其中Illumina更是全球测序市场的巨无霸企业（2016年数据显示，Illumina、赛默飞世尔的市场占有率分别是71%和16%）。两家公司占据了市场占有率排行榜的前两位，他们也是最直接的竞争对手。
比如在国内市场，Illumina和贝瑞基因合作、安诺优达开发了一款适用于中国无创产前检测市场需求的测序仪基因测序仪NextSeq CN500和NextSeq 550AR，并且其已经得到CFDA批准，在中国市场进行销售。
CFDA注册审批后的测序平台能够部署到医院，医院可以独立操作。
另外，Illumina还先后与燃石医学、诺禾致源、艾德生物等企业达成合作，Illumina提供设备和相关试剂，合作公司开发应用于肿瘤诊断、生殖健康等领域的试剂盒。
赛默飞世尔则授权达安基因、博奥生物，分别合作开发了DA Proton、BioelectronSeq测序仪。同时，赛默飞世尔还有大量的追随者。
国内的战场只是他们全球市场的缩影，这两家公司在全球市场都是最直接的竞争对手。
那么这一次，冤家聚头居然谈起了合作，原因是什么呢？很大一部分原因是因为市场出现了共同的对手。
Illumina、赛默飞世尔、罗氏是测序仪器是市场的三巨头，他们掌管的测序行业上游的命脉，在全球拥有绝对的话语权。而随着测序行业越来越成熟，市场蛋糕越来越大，他们的一些客户开始转战上游市场，变成竞争对手。
早年间，由于这些公司的技术、市场并不成熟，即使宣布切入上游市场，也鲜有产品露出，后来者对他们的威胁并不大。而随着时间的推移，这些公司不管是人才储备还是技术储备都逐渐成熟，曾经的追随者羽翼渐丰。
如今，Illumina、赛默飞世尔周围围绕着一批新的对手。这些对手对他们虎视眈眈，希望能够进入到核心位置。
华大基因在今年连续推出了两款款新型测序仪，尽管与HiSeq X、Life Ion Proton的市场占有率相差甚远，但BGISEQ已经通过科研方式证明了产品的可行性，正逐渐被行业接受和认可。
2017年4月，开放期刊GigaScience公布了BGISEQ-500测序平台完成的首个人类基因组重测序数据。
BGISEQ-500相关测序数据的公布，也为国产测序仪的发展奠定了基础。
GigaScience期刊公布的数据中，其中有一部分就是BGISEQ-500与Illumina公司的HiSeq2500的测序数据比对。
结果显示，BGISEQ-500 PE100和HiSeq2500 PE150两组数据具有较高的比对率、相似的基因组覆盖度以及变异检测结果。
短短一年多时间，在科研方面，BGISEQ-500平台在国际学术期刊上，已发表23篇高水平文章，合计影响因子142。
此外，对中国的企业而言，国产化的设备在产品价格、后续服务质量上更具优势。当产品具备了Price Guarantee和 Quality Guarantee，再加之医疗器械进口替代的宏观趋势，华大基因很有可能逐渐撼动他们在国内市场的地位。
BGISEQ-500平台的通用测序仪及其配套试剂、NIFTY®检测试剂盒及核酸提取试剂盒在2017年均获得了欧盟医疗器械CE Mark。
这意味着由中国智造的测序仪及其产品满足了欧洲体外诊断器械相关指令的法规要求并且满足欧盟严格的安全和健康要求。另一面，这预示着华大测序仪的定位不仅仅是国产替代，而是要走出国门。
赛默飞世尔科技临床新一代测序和肿瘤学的总裁Joydeep Goswami表示，“通过这项协议，更多的科研客户如今能够享受Ion AmpliSeq技术的优势，同时赛默飞世尔将继续向科研市场推广Ion Torrent靶向测序方案，并加速其在临床领域的关注和势头。”
此项协议让Illumina的客户能够利用靶向重测序，作为大规模外显子组和全基因组探索研究的后续行动。它最终支持两家公司通过提供完整的NGS流程方案，来推动人类疾病研究的科学进步。
“此次合作代表我们迈出了重要一步，让高性能且灵活的扩增子试剂能够用于Illumina市场领先的测序系统产品线上，”Illumina的首席商务官Mark Van Oene表示。“现有客户如今可享受到AmpliSeq试剂，这样就能够更好地利用他们的系统。”
除了同类测序仪，三代测序仪被越来越多的人所接受。在国内，瀚海基因的三代测序仪还获得CFDA批准能够用于临床及测序。这些信息也给二代测序仪生产商造成了压力，除了担心自己的市场被其他同类公司挖走以外，还有来自另一“物种”的威胁。
三代测序仪并不是二代测序仪的升级，而是另一条技术路径的测序技术。第三代测序技术是指单分子测序技术，能够实现了对每一条DNA分子的单独测序。
第三代测序技术原理主要分为两大技术阵营：
第一大阵营是单分子荧光测序，代表性的技术为美国螺旋生物(Helicos)的SMS技术和美国太平洋生物(Pacific Bioscience)的SMRT技术。
第二大阵营为纳米孔测序，代表性的公司为英国Oxford Nanopore，新型纳米孔测序法（nanopore sequencing）是采用电泳技术。
三代测序弥补了二代测序读长较短的劣势，但准确性却一直让人觉得鸡肋。深知自己致命的弱点，并在不断升级换代。
以Oxford Nanopore的MinION为例，2014年MinION的早期试验阶段误差率在30%左右，到了2016年最新版本的R9已经将各类型DNA测序错误率降低到了2-13%。2016年10月正式发布的R9.4再次对产品整体性能做了进一步提升。
另外，Oxford Nanopore的所推出的均是小型化测序仪，例如比iPad大一些的平面测序仪PromethION、U盘大小的掌上测序仪MinION。其概念产品SmidgION更是能够与手机兼容，或许能够让基因测序步入手机时代。
除了测序仪产品，Oxford Nanopore也在寻求其他突破。
公司在2016年推出了自动化样本制备系统，他们的目标是将样品制备时间缩短到10分钟。新产品能将原始的生物样品转化成立即可测序的形式，无需人工干预，且延续了之前产品便携带的特点，能够与MinION或PromethION测序仪直接对接。
Oxford Nanopore是一家年轻的公司，他们不仅仅是测序产品的生产，更多的是概念上新的突破。
以往人们认为的基因测序必须在实验室中才能进行，且需要繁琐步骤、大型仪器。而以Oxford Nanopore为代表的小型测序仪生产商却把测序过程搬到了室外，甚至搬到了太空。
也许，这些便携式、实时测序的产品有可能像2007年苹果发布iPhone一样，改变行业的游戏规则。
面对市场威胁，合作抱团，先击垮新的入局者是明智的策略。但如果产品没有变，仅仅是渠道的改变似乎并不足以守卫市场，两家公司又各自在会上推出了新产品。
赛默飞世尔在会上宣布推出了最新下一代基因测序仪Ion GeneStudio S5系列。这是一款桌面型测序仪，与之配套的还有Ion 550的5款芯片。
Ion GeneStudio S5系列最长可以实现600bp读长，适用于肿瘤研究、遗传病、微生物及感染性疾病等多个领域的研究。通过灵活的芯片模式，新的测序平台可用于各种研究领域内的小型或大型项目，并降低实验成本。
Illumina则发布了又一款小型测序系统iSeq™ 100。
iSeq 100占地仅1平方英尺，集成了比Illumina以往任何一款测序仪都紧凑的NGS检测能力。新产品结合了公司成熟的边合成边测序（SBS）技术以及互补金属氧化物半导体（ CMOS）检测技术，代表了与以往完全不同的架构，在产出高精度数据的同时成本大大下降。
更值得一提的是，该测序仪目前的标价仅19900美元，几乎所有的实验室都能够消费。
“不到20000美元的价格让任何研究人员都可以在他们的实验室中享受到Illumina测序仪的精准性能”，Illumina总裁兼首席执行官Francis deSouza表示。“iSeq 100能否为生殖系和体细胞肿瘤分析、16S微生物分析及靶向基因表达等一系列应用提供了稳定和可靠的服务。”
Illumina将继续开发iSeq架构，后续将不断扩大数据产出，同时减少运行时间。未来这些改进将会帮助公司打开新的市场，将NGS技术扩展到快速微生物组测序、食源性病原体检测及医源性感染监测等应用领域。
iSeq 100现已接受预订，将在2018年第一季度出货。不过19900美元的价格仅限于美国，其他区域价格会有所浮动。
文|周梦亚
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