披荆斩棘 | 诺唯赞推出全新扩增子建库试剂盒,全方位提高扩增子文库覆盖度和均一度
近年来,靶向测序凭借成本低、数据利用率高、组合灵活等优势,在临床的疾病辅助诊断、治疗以及肿瘤基因检测中发挥出积极的作用。
突变基因测序
病原体/环境
微生物鉴定
科学研究
从上面的比较可以看出,使用扩增子建库富集目的DNA的方法在多个方面显著优于杂交捕获方式,特别是在起始量低,用时较短和成本较低方面。
1、标准扩增子建库流程
标准扩增子建库流程为在完整模板的基础上投入多重扩增的Panel进行多重扩增,随后将得到的扩增子进行引物消化,消化掉多余的引物二聚体以及两端引物本身的部分序列,获得平末端的结构,与接头连接后形成完整文库。
2、两步法扩增子建库流程
图2. 两步法扩增子建库流程。
两轮扩增的方法原理是在基因组基础上,投入的多重扩增的引物带有一定的修饰,经过第一轮多重扩增之后,序列两端带有一段接头序列,第二轮扩增将Index添加上去,经过两轮扩增形成完整文库。
3、多重PCR产物扩增子建库流程
图3. 多重PCR产物扩增子建库流程。
多重PCR产物扩增子建库原理是在待测基因组上投入无修饰的多重扩增引物进行多重PCR,产物经过纯化后,进行常规DNA建库。
Vazyme推出多重扩增子建库试剂盒升级产品——VAHTS®AmpSeq Library Prep Kit V3(Vazyme #NA210),产出与均一性双向起飞!
1. 文库产出高
图4. 不同起始投入量和Panel条件下文库产出。
在不同起始投入量下(1ng、10ng、100ng),Vazyme #NA210均能高效建库,且同类产品相比,文库产量更高。
2. 测序数据质量高
(1)更高的测序覆盖度
图5. 不同起始投入量和Panel条件下文库的测序覆盖度。
测序数据质量方面,Vazyme #NA210在不同起始量和Panel条件下覆盖度均高于同类产品。
(2)更优的测序均一性