非肿瘤纯生信3分SCI思路分享

没有时间、没有经费做实验的穷苦科研人，利用这方法零成本的方法照样可以发3分的SCI。下面我们将这种方法分享给大家，这里介绍的文章题目如下：Integrative analyses of biomarkers and pathways for adipose tissue after bariatric surgery ，文章发表在ADIPOCYTE上，目前这个期刊的影响因子 ：3.164，作者研究是的减肥手术方向。

研究目的：

我们探讨了减肥手术后有关多种益处的潜在生物标志物和分子机制。

研究方法：

通过分析来自GEO的两个表达谱数据进行确定减肥手术后皮下脂肪组织（AT）的差异表达基因（DEG）。随后，研究了富集分析，GSEA，PPI网络以及gene-microRNA和gene-TFs网络，以确定hub基因和相关信号通路。

研究结果：

共表达的DEGs包括一个被上调的基因和22个被下调的基因。富集分析表明，DEGs下调与炎症反应密切相关。GSEA提供了综合的证据，表明大多数基因在促炎途径中富集，而手术后的基因组在代谢中富集。我们在PPI网络中鉴定了9个hub基因，分别通过Attie Lab Diabetes和DiseaseMeth数据库验证了它们在肥胖中的高表达和低甲基化。DGIdb还用于预测可能逆转异常高的毂基因表达的潜在治疗剂。减肥手术可引起从肥胖的促炎状态向消炎状态的重大转变，脂肪细胞代谢功能得到改善，这是减肥手术后AT功能改善的关键机制。

研究结论：

我们的研究加深了对减肥手术益处的机械理解，并为进一步研究提供了潜在的生物标志物或治疗靶标。

分析思路：

1、下载两套GEO数据，分别做差异分析（绘制数据矫正图、火山图、热图）

2、取两套数据交集的差异基因

3、GO、KEGG富集分析，GSEA分析

4、PPI分析，筛选hub基因

5、分析hub 基因在肥胖中的表达

6、分析hub基因的甲基化水平

7、构建gene-miRNA, gene-TF网络

8、构建drug-gene网络，挖掘潜在的药物