听说最近有很多人讨论这个图形
前一段时间,有个图形被大家讨论过很多次,也出现了许多的绘制方式。宏基因组也曾转载过一篇文章,讨论了这种图形的实现方式。Science组合图表解读。
就是下面这张图片
许多人对这种图形进行了探索
总的来说这些推送对这张图形的实现由两种思路。1,使用基础绘图包,2,使用ggplot。似乎基础包更容易一些,使用corplot来绘制相关图形,然后添加其他内容,第三篇推送还做了一些解读。
为什么我还要自己探索呢?有以下几个原因:
我不愿意使用基础包实现这种图形的绘制,而以上推送就ggplot的实现方式距离实际运用还有一段距离。
这张图用于微生物生态方面很适用,结合mantel检验和相关分析的部分我加入图形绘制的前处理。
我需要将这张图形整合到phyloseq的分析体系中。整合pipline,需要一键绘图。
封装成给一个函数吧,所以就不放代码了,在弄弄
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