ISME：影响根相关真菌群落结构的驱动因素
英国埃塞克斯大学Alex J. Dumbrell于2019年1月28日在《The ISME Journal》上发表题目《Are drivers of root-associated fungal community structure context specific?》的文章。该研究分析了英国6个地点的盐沼的真菌群落结构，揭示了真菌群落结构和多样性的主要驱动因素。
研究摘要
植物根相关真菌群落的组成和结构由当地非生物和生物条件决定。然而，非生物和生物因子对不同的环境和生态环境以及真菌功能群而不同。因此，了解不同背景下与根相关的真菌群落生态学的因素是迈向更具预测性框架的第一步。
本研究通过高通量测序（约55 M Illumina元代码编码序列）分析来自两个地理区域（冬季和夏季，英格兰东南部和西北部）的六个英国盐沼的> 260个植物根相关真菌群落，来探究生物和非生物因子在环境和生态背景下的相对重要性。
与根相关的真菌多样性水平与森林和温带草原真菌多样性相当，比盐沼真菌多样性多一倍。虽然非生物变量通常是最重要的，但是一系列位点和空间尺度特异性的非生物和生物因素对多样性和群落组成也是重要的。因此，一个地点所形成的多样性的预测模型，用到其他地方效果很差。来自相同功能组的真菌分类群对多样性和组成的特定驱动因素的反应相似。因此，地点，空间尺度和功能组是关键因素，如果考虑到这些，对真菌群落生态学的预测性可能更准确。
文中主要图片说明
图1 采样地点。
图2 基于Jaccard不相似指数的真菌群落之间相似性的NMDS图。
图3 六个研究地点的非生物和生物变量的主成分分析（PCA）双标图。
图4 当使用预测其他站点OTU丰富度时，操作分类单元（OTU）丰富度模型的预测误差。
图5 a每个盐沼中真菌操作分类单位（OTU）的生物和非生物模型的AIC得分。b每个站点中真菌OTU的比例，其丰度更好地用生物或非生物变量建模。
图6 与生物和非生物环境变量相关的真菌生态群的估计系数。
图7 每个生态群中每个功能组的真菌操作分类单位（OTU）的预期和观察数量。
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