基因敲除细胞株技术介绍
基因敲除细胞系
在我们研究基因功能的时候,基因敲除(Knock out,KO)是实现基因loss of function的重要调控方式。相比于传统的基因干扰(RNAi)技术,基因敲除可完全消除目的基因的表达,最终使其蛋白完全不表达或功能彻底丧失,也让我们可以更好地观察细胞表型的变化。
但基因敲除细胞模型的构建过程较为繁琐,需要耗费很长的实验周期,而且对于经验不是很丰富的研究者,很容易出现做了三四个月却最终敲除效果不彻底的情况,导致研究进度受阻。
细胞敲除成功案例
项目名称:人HCT116细胞PSME3基因敲除(片段敲除)
1、gRNA设计:
gRNA位点1:ATACGCTACCTAACATGGCTGGG; gRNA位点2:CCAGCATGCAAAATACAATGGGG
2、引物合成及质粒构建:
3、细胞转染
首先确定最佳的电转参数,进而通过电转的方式将载体转染进细胞。
4、筛选单克隆细胞并培养
5、PCR及电泳鉴定:
鉴定策略的原理如下:
6、测序鉴定:
ATAAACAGAGGATTTAAGACTTTTGTTATGTTTTAGACGC-del;1809bp--AGTGGCTAATGCCT GTAATCC CACCACTTTGGGAGGCCAA
7、克隆状态:
细胞检测结果:无菌、无支原体
培养体系:McCoy's 5A+ 10% FBS + 500μg/mL Hygromycin;1:3传代
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