Nature 子刊 | 创伤后应激障碍综合征的全基因组相关性研究
推荐:江舜尧
编译:白羽
编辑:马莉
研究背景 创伤后应激障碍( PTSD)是指个体经历涉及自身或他人的实际死亡,或受到死亡的威胁,或严重的受伤后,所导致的个体精神障碍。这种精神障碍经常出现在有过战场经历的士兵或者经历过重大精神创伤的普通个体上。尽管PTSD是一种世界性的公共健康难题,但是关于这种疾病的发病机制不为人所知。过去的一些研究指向某些基因和PTSD的发病有关联,但是这些研究结果的可靠性和显著性不能兼顾。
研究方法 本文对确诊PTSD的超过165,000名老兵利用SNP芯片进行全基因组关联性分析,筛选出关联性最高的基因,同时与多个数据库进行比对和验证,最终证实这些风险基因与PTSD的发病有高度相关性。
结果 GWAS分析表明,共有LINC01360、CAMKV、KCNIP4、HSD17B11、MAD1L1、SRPK2、KANSL1和TCF4八个基因和PTSD高度相关,但是这种相关性存在一定的种族和性别差异,其中CAMKV、KANSL1和TCF4的关联性最为显著。基因连锁分析表明,这些基因的连锁基因同样和智力发育以及各类精神障碍发病有很强的相关性。与人类和动物的组织与细胞类型转录谱数据库进行富集分析后证实,来自特定区域的脑组织和细胞与PTSD创伤性再体验症状有关。这种相关性的重复性同样通过比对UK Biobank数据库得以证实。
结论 本文研究结果表明,CAMKV、KANSL1和TCF4这三个基因的单核苷酸多态性与PTSD的创伤性再体验症状有高度的相关性,为研究PTSD的发病和治疗提供重要参考价值。
文中重要图片说明
图1 | GWAS分析结果中创伤性再体验症状高度相关的基因列表和SNP位点
图2 | GWAS和种族Meta分析的曼哈顿图
图3 | 第17号染色体相关区域的曼哈顿图
图4 | 顺式表达量性状位点eQTLs关联的十三个脑区域
图5 | 基于基因关联性分析的曼哈顿图
图6 | 组织和细胞类型富集分析结果