直播我的基因组分析-目录-持续更新
【直播】我的基因组(七):从整体理解全基因组测序数据的变异位点
【直播】我的基因组(十四):bam文件给按照染色体给分割成小文件
【直播】我的基因组(十六):提取左右端测序数据比对到不同染色体的PE reads
【直播】我的基因组(十七):初步分析一下multiple mapping 的情况
【直播】我的基因组(十八):初步分析PCR duplication的情况
【直播】我的基因组21:为什么我算出的染色体覆盖度与公司差异甚大
【直播】我的基因组24:用GATK对SAM格式的文件进行重排
【直播】我的基因组25:用bcftools来call variation
【直播】我的基因组26:GATK的realign对最后的结果影响到底有多大
【直播】我的基因组28-必须要理解vcf格式记录的变异位点信息
【直播】我的基因组 29:统计1000 genome hom-het ratio
【直播】我的基因组 31:vcf文件标记dbSNP的rsID号
【直播】我的基因组 33:用samstat软件对sam文件做统计
【直播】我的基因组 34:Qualimap对比对好的bam文件进行统计及可视化
【直播】我的基因组 35:bam格式转化为bw格式看测序深度分布
【直播】我的基因组 36:这些可能是somatic突变的位点究竟是什么?
【直播】我的基因组 37:gwas研究结果在我身上得到了验证
【直播】我的基因组 41:按照不同的lane来call variation
【直播】我的基因组 42: 不同lane的variation的比较
【直播】我的基因组 44:比对文件画profile和heatmap图
【直播】我的基因组49:Y染色体的SNV不能用常规流程来找?
【直播】我的基因组50:从测序深度和位点间距来看SNV分布情况
【直播】我的基因组51:画全基因范围内的染色体reads覆盖度图
【直播】我的基因组54:把我的variation跟dbSNP数据库相比较
【直播】我的基因组55:简单的PCA分析千人基因组的人群分布
【直播】我的基因组58:用R包SNPRelate来对我的基因型跟hapmap计划数据比较
【直播】我的基因组63:wegene芯片跟二代测序的简单比较