生信小技巧第10课-生物信息学的背景知识多吗
长期更新列表：
生信小技巧第07课-从ncbi等数据库网站下载大批量原始测序数据
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其实所谓的背景知识，早在两年前我开创生信技能树论坛的时候就规划好了：
公开课
山东大学 生物信息学https://www.bilibili.com/video/av22086086
生物信息学：导论与方法(北京大学) http://bilibili.com/video/av10042290
背景知识 目录如下：
超链接在：生信基础知识100讲 （阅读量超2万！）
数据库专题
1. 一文看懂NCBI的refseq
2. 浅谈Entrez ID
3. 带你认识GEO数据库
4. NCBI数据库专题之Taxonomy
5. 基础数据库之dbSNP
6. pubmed
7. OMIM数据库
8. Nr,GenBank, RefSeq, UniProt 数据库的异同
基础概念专题
1. 浅谈RPKM,FPKM,RPM,TPM的区别
2. 二代测序的barcode/index
3. De Novo sequencing vs resequencing
4. 浅谈FastQ和FastA格式
5. NGS基础概念-depth and coverage
6. 名词package
7. paired-end Reads
中心法则专题
1. 中心法则-DNA
2. 中心法则-RNA
3. 中心法则-蛋白质
4. DNA复制
5. NGS与转录
6. 中心法则之翻译
7. 逆转录
测序平台专题
1.Sanger测序
2.illumina测序
3.罗氏454测序
4.SOLiD测序
5.Ion Torrent测序
6.pacbio测序
7.纳米孔测序
数据格式专题
1.FastQ和FastA格式
2.SAM格式
3.gff/gtf格式
4.Bigwig/Wiggle格式
5.bed格式
6.vcf格式
7.Blast&Blat
测序数据质量控制专题
1.测序数据质量控制之FastQC
2.测序数据质量控制之cutadapt
3.测序数据质量控制之sickle
4.测序数据质量控制之Trimmomatic
5.测序数据质量控制之fastx Toolkit
6.测序数据质量控制之RSeQC
7.测序数据质量控制之CHIPQC
组学专题
1.组学专题-基因组学
2.组学专题-转录组学
3.组学专题-表观基因组学
4.组学专题-微生物组学
5.组学专题-蛋白质组学
6.组学专题-代谢组学
变异形式专题
1.变异形式专题-参考基因组
2.变异形式专题-基因结构
3.变异形式专题-SNP多肽性
4.变异形式专题-SNV
5.变异形式专题-CNV
6.变异形式专题-SV
7.变异形式专题-INDEL
遗传资源数据库专题
1.遗传资源数据库专题-1000genomes
2.遗传资源数据库专题-hapmap
3.遗传资源数据库专题-EXAC
4.遗传资源数据库专题-ESP6500
5.遗传资源数据库专题-UK10K
6.遗传资源数据库专题-COSMIC
7.遗传资源数据库专题-TCGA
8.遗传资源数据库专题-gnomAD
转录组专题
转录组专题-可变剪接
转录组专题-融合基因
转录组专题-WGCNA分析
转录组专题-变异位点
转录组专题-芯片异同
转录组专题-GTEx
转录组专题-BodyMap
功能数据库专题
功能数据库专题-GO
功能数据库专题-KEGG
功能数据库专题-BIOCARTA
功能数据库专题-reactom
功能数据库专题-DAVID
功能数据库专题-GSEA