中药可以结合功能基因组学治疗疾病吗?

传统“望、闻、问、切”是对患者的临床表现进行诊断,功能基因组学是通过对患者生物学样本检测并通过表观精准数据分析对患者疾病进行诊断。二者可以结合应用吗?近年来我们一直在探究这种传统与现代医学技术相结合的方法。
随着人类对基因组越来越深入的研究,我们可以发现目前大部分疾病的发生发展都与功能基因组的异常表达有关。同时我们也发现,中药也可以对基因组的表观调控发挥明显作用。因此,在整个基因组范围内,研究中药在不同疾病状态下基因表达调控的机制与相互作用关系有重要价值,据此发现能够调控该疾病相关基因谱的潜在中药治疗药物。我们期望通过中药功能基因组学的应用,可以对每个患者的基因表达情况进行分析,并进行精准中药组方治疗,这才达到了真正意义上的中药精准治疗。
新冠疫情发生之后,我们将新型冠状病毒感染后人体的功能基因组变化与中药对人体基因组影响数据结合,开展了药物预测研究,寻找具有潜在抗冠状病毒作用的药物;在此基础上,结合传统中医方法,对预测中药进行组方;最后通过临床研究加以验证。
应用基于功能基因组学分析法建立的EpiMed表观精准治疗平台,我们分别对不同病毒亚型的关键基因开展药物基因组学关联分析,最终选取负相关西药6个(奈韦拉平、泛昔洛韦、西多福韦、氟伐他汀和依那西普,益赛普),负相关中药28个,根据中医传统理论经中医专家组方后又最终得方LW-02(桑寄生、连翘、鱼腥草、广藿香、虎杖、生甘草、薄荷、葛根、白头翁、益母草、浙贝、瓜蒌子、败酱草,共13味中药)。
为探讨中药组方对COVID-19的治疗作用,对前期应用文本挖掘方法获取的各中药调控人体基因的表达谱进行整合分析。结果发现,现有研究已发现该组方中药对人类基因组1.3%的基因具有调控作用,其中主要是免疫调节、病毒感染及细胞周期有关的基因。该组方可能对大量炎症反应相关基因具有下调作用,包括TNF信号通路中的关键蛋白TNF、Th17 细胞分化信号通路中的IL1B、IL2、IL10等。此外,该组方还对凋亡、坏死等细胞死亡信号通路具有抑制作用,其中包括抑癌基因TP53等,结合前期研究,提示该组方可能与病毒感染介导的细胞异常程序性死亡关系密切。
由此我们推测,该组方对COVID-19的治疗作用可能就在于通过互作转录组作用原理,对COVID-19在人体内的生存和对人体的致病分子通路的抑制和逆转而发挥抗病毒作用;同时,兼具免疫调节及抑制正常组织细胞异常凋亡及坏死的多重治疗作用。
为了评价以上中药组方的有效性,本研究自2020年2月起,对黑龙江省农垦红兴隆管理局中心医院的常规抗病毒治疗无效及首次确诊COVID-19患者采用中西医联合方案(“LW-02”+利巴韦林+阿比朵尔+痰热清)治疗,年龄、性别、临床分型(新冠肺炎诊疗指南第七版)不限。截至2020年3月,一共收治8例患者,其无症状感染者3例,普通型患者3例,重型患者2例(指氧饱和度分别为86、91)。其中5名患者入院后即开始接受常规抗病毒治疗(利巴韦林+阿比朵尔+痰热清),治疗2-3周无效后加用中药治疗,另外3患者确诊后即开始中西医联合治疗。
经过2周联合治疗后,6例患者明显好转,2例核酸转阴达到治愈标准。其中2例重症患者采用联合方案治疗后全部好转。加用“LW-02方案”治疗2周后,全部8例患者白细胞计数,中性粒细胞计数,淋巴细胞绝对值,动脉血氧饱和度显著上升,发热、腹泻等症状明显改善,C反应蛋白显著下降。所有患者在治疗中均未出现并发症,使用中西医联合方案治疗后均未出现因不良反应而中途终止治疗。
此次研究以生物信息学—临床医学相结合的研究模式,探讨了COVID-19的治疗问题。需要指出的是,本研究病例数少,但对重症的疗效是确切的,进一步疗效有待大样本前瞻性研究证实。

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