推荐：江舜尧
编译：Frank
编辑：小菌菌
斯坦福大学地球系统科学系Bennett J. Kapili和Anne E. Dekas等人于2020年1月06日在The ISME Journal发表题目为《Evidence for phylogenetically and catabolically diverse active diazotrophs in deep-sea sediment》的文章，该文章的结果在考虑现代和古代环境方面具有广泛的生物地球化学意义，并强调需要进一步分析以探索具有代表性的海洋沉积物中固氮菌的多样性和活性的需求。
文章摘要
固氮微生物通过减轻氮限制来调节海洋生产力。但是，目前对占地球近三分之二栖息地的深海沉积物中重氮菌的同一性和活性了解甚少。作者使用15N-DNA稳定同位素探测技术和nifH序列分析，从2893 m水深处收集的太平洋沉积物中鉴定出候选固氮菌。总之，这些方法可检测出活跃固氮菌的多样化集群，包括酸杆菌门、厚壁菌门、硝化螺旋菌门、γ-变形细菌纲和δ-变形细菌纲的成员。δ-变形细菌纲，主要是脱硫杆菌目和除硫单胞菌目的成员，是检测到的最丰富的固氮菌，并且显示与nifH序列相关的最大多样性。包括酸杆菌门在内的检测到的谱系，以前没有被证明可以固氮。固氮菌在分解代谢上表现出多样性，具有使用氧、氮、铁、硫和碳作为末端电子受体的潜力。因此，底栖固氮生物可能会在一系列地球化学条件下持续存在，并在地质时间尺度上提供稳定的固定氮源。研究结果表明，深海沉积物中固氮的群落在系统发育和分解代谢上是多种多样的，并为研究深海微生物的生态和生物地球化学作用开辟了一条新的途径。
文中重点图片说明：
图1 | 本研究中采用的沉积物岩芯的采样位置和先前测量的N2固定。
图2 | 通过15N-SIP和DNA测序分别鉴定了15N标记微生物和含nifH分类单元的分类学多样性。
图3 | 原始沉淀物（未培养）和培养的15N标记微生物的相对丰度。
图4 | 回收的nifH序列的多样性。
图5 | 15N标记微生物最近亲缘关系的代谢谱。
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