Semin Cancer Biol综述:非编码RNA在皮肤恶性肿瘤和自身免疫性疾病的进展中的作用
导读皮肤是人体最大的器官,对人类的生存和生存至关重要。此外,与皮肤生物学相关的发育和生理机制对体内平衡至关重要,因为它们的失调集中于包括癌症在内的许多皮肤病的发病机制。大多数人类基因组转录缺乏蛋白质转化潜力,被称为非编码RNA (nc-RNAs),其中包括环状RNA (circRNA)、小核RNA(核内小RNA),小核仁的RNA (snoRNA),微RNA (microrna的),长非编码RNA (lncRNA), piwi-interacting RNA (piRNAs)。这些ncRNA通过在转录、转录后和表观遗传学水平上控制基因表达,在大多数生物稳态和疾病发展的调控机制中发挥着重要作用,因此在临床前和临床研究中受到了广泛关注。在这篇综述中,作者阐述了nc-RNAs如何在皮肤稳态的发展和维持及其功能中发挥关键作用,以及最重要的是,nc-RNAs表达和功能的失调如何在包括癌症和自身免疫性皮肤病在内的皮肤疾病的发病机制中发挥关键作用。考虑到nc-RNAs在癌症抵抗、转移和自身免疫性疾病中的重要作用,作者也强调了它们在皮肤疾病的预后和治疗中有前景的作用。论文ID题目:Role of non-coding RNAs in the progression and resistance of cutaneous malignancies and autoimmune diseases译名:非编码RNA在皮肤恶性肿瘤和自身免疫性疾病的进展和抵抗中的作用期刊:Semin Cancer BiolIF:11.09发表时间:2020.7.24通讯作者单位: 哈马德医疗公司DOI号:https://doi.org/10.1016/j.semcancer.2020.07.003主要内容现在可以明显看出,超过98%的人类RNA转录本属于非编码基因组,而其余不到2%的RNA转录本构成蛋白质编码区,这些编码区对于维持生物稳态和发育至关重要,如图1所示。对人类基因组转录本的复杂分析显示,转运RNA (tRNA)、核糖体RNA (rRNA)、信使RNA (mRNA)和nc-RNA (cirRNA、snRNA、snoRNA、miRNA、lncRNA和piRNAs)分别占89%、8.9%、0.9%和约1%。数十年的研究已经将人类基因组的非编码垃圾RNA转录本的概念细化为功能调控片断,这些片断具有多种生物现象的分子和细胞潜力整合,包括转录后修饰、染色质重塑和信号通路,如图1所示。此外,许多发现阐明了这些nc-RNA与各种分子靶标相互作用并影响其功能以启动特定的细胞反应和命运,从而证实了这些非编码转录本是细胞和生物体内稳态和失调的重要调节剂,这些非编码转录本的表达和功能与多种人类疾病(包括癌症)的发病机理有关。以下几种类型的nc-RNAs已经得到了很好的解释:miRNA、Long-noncoding RNAs (lncRNAs)、Circular noncoding RNAs (circRNAs)和Piwi-interacting RNAs (piRNAs)。
图一:非编码RNA的类型非编码RNA和表观遗传修饰在皮肤癌变如上所述,nc- rna是不编码任何蛋白质产品的RNA。它们非常丰富,构成了人类基因组的绝大部分。非编码RNA如lncRNA已被提出作为皮肤癌的生物标志物和/或治疗靶点。目前已知lncrna在皮肤癌的进展中发挥重要作用,特别是在皮肤癌的转移过程中,如表1。
表一:非编码RNA的列表和他们报告的作用在皮肤癌进展非编码RNA在皮肤癌进展和耐药性中的作用在一项寻找黑素瘤转移lncRNA特征的早期研究中,作者检测了6个转移相关的lncRNA,以确定它们在黑素瘤淋巴结肿大中可能的作用,结果发现lncRNA HOTAIR在淋巴结转移中高表达,相对于匹配的原发性黑素瘤。抑制其作用可以减少明胶基质的浸润和降解。HOTAIR在黑素瘤进展中的作用也得到了其他分析的支持。另一项研究也评估了6种lncrna在黑素瘤中类似的转移特征,报告了MALAT1(转移相关肺腺癌转录本1)与淋巴结转移的关系,UCA1(尿路上皮癌相关1)与晚期黑素瘤分期的关系。随后的研究进一步证实了UCA-1在黑素瘤细胞增殖和侵袭中的作用,证明其通过调控FOXM1发挥作用。同样,在后来的一项研究中,MALAT1对miR-22的海绵作用,从而促进黑色素瘤的进展和转移。在图2展示了ncRNA如何在皮肤癌进展和耐药性中发挥关键作用。
图二:非编码RNA在癌症进展和耐药性中的作用总结皮肤是人体最大的器官,是人体抵御各种环境、物理化学、生物和外来生物的第一道防线,因此容易引起包括癌症在内的各种皮肤疾病。在这篇综述中,作者总结了nc-RNAs在皮肤稳态和包括癌症和皮肤自身免疫性疾病在内的各种皮肤病理状态中的作用。近年来,nc-RNAs通过控制角质形成细胞的增殖和分化,在皮肤发育和功能如屏障功能、色素沉着、毛发周期和伤口愈合中发挥重要作用;保护角质形成细胞免于凋亡;刺激细胞迁移;杀菌作用;调控头发生长和生长素周期;在伤口愈合中调节炎症期、血管生成、再上皮化和重塑。此外,还需要进行更多研究,以探索各种最近发现的nc-RNA(circRNA,piRNA和snRNA)在皮肤疾病和病理学中的作用,包括机理研究,以了解nc-RNA与进展和转移的关系,以便 疾病诊断和治疗可以取得进一步进展。原文链接https://doi.org/10.1016/j.semcancer.2020.07.003参考文献1. F. Bray, J. Ferlay, I. Soerjomataram, R.L. Siegel, L.A. Torre, A. Jemal, Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries, CA Cancer J Clin 68(6) (2018) 394-424调控性非编码RNA与外泌体研究策略与课题设计网络班(两天集中培训 ,医药加zoom会议室,详细档期扫码咨询)为帮助非编码RNA与外泌体研究的科研人员掌握本领域的研究套路与常用技能, 考虑目前在疫情期间的实际情况,我们决定在线下30多期得经验上召开【非编码RNA与外泌体研究策略与课题设计网络实战精讲班】,为了保证学习效果,医药加采用国际顶级的zoom网络会议平台授课,互动体验效果好!课程可免费回放,专家微信群指导,确保你能学会!课程简介非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)研究是当今生命科学领域发展最迅速的前沿领域之一。非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色,近年来的研究成果经常入选CNS年度十大科学突破。目前在高等生物中,存在着一个巨大的、尚未被完全发现的RNA世界。人类基因组转录区高达76%,但转录产物中只有不到2%是编码蛋白质的mRNA,其他都是非编码RNA,其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、环状RNA(circular RNA,circRNA)等调控性ncRNA因其重要的调控功能,受到科学家们广泛关注。近年来,非编码RNA一直是生命科学领域的研究热点,也是国家自然科学基金等鼓励申报的重要领域。该研究将从全新的角度揭示生命调控的分子机制,并为人类疾病的诊断和防治提供理论依据和新的技术。Exosomes可以由多种细胞类型(免疫细胞、心血管细胞、神经细胞、干细胞、肿瘤细胞)释放,因此,exosomes也会参与多种生理或病理过程,如抗原呈递、RNA转运、组织修复、神经退行性疾病、肿瘤转移、代谢重建等。Exosome中含有细胞特异的蛋白、脂质和核酸,能作为信号分子传递给其他细胞从而改变其他细胞的功能。Exosome在体内存在的广泛性和获取的便捷性,已经成为了疾病诊断治疗的潜在有效方式,在精准医学发展上有着光明的前景。开展本次研讨会的目标是为了让刚接触外泌体领域的年轻科研人员能掌握尽快上手做这方面的研究方法,为一些已经在外泌体研究中碰到问题的研究者解决实际科研问题。学习预期1. 掌握调控性非编码RNA常用分析工具使用方法2. 熟悉10种调控性非编码RNA研究思路3. 掌握调控性非编码RNA常用研究技术4. 熟悉外泌体与调控性非编码RNA关联设计思路5. 熟悉调控性非编码RNA与外泌体相关国自然基金标书写作课程安排时间安排课程表介绍第一天9:00-10:30调控性非编码RNA简介调控性非编码RNA概念及重要分类调控性非编码RNA的来源与生成机制10:30-10:45茶歇10:45-12:00调控模式及研究意义调控性非编码RNA的调控模式调控性非编码RNA研究意义12:00-13:30午饭及午休13:30-15:00调控性非编码RNA常用研究技术(一)表达谱芯片与RNA-seq数据分析实时定量PCRNorthern Blot原位杂交Knock down和Over-expression15:00-15:20茶歇15:20-17:30调控性非编码RNA常用研究技术(二)RNA-RNA、RNA-DNA、RNA-蛋白质等相互作用研究技术报告基因分析、ChIRP、RIP、RNA pull-down转录调控技术:ChIP、EMSA、Oligo pull-down、Run on、Run off第二天9:00-10:30调控性非编码RNA相关数据库介绍(一)microRNA:miRbase、targetscan、mirtarbase、RNAhybrid等10:30-10:45茶歇10:45-12:00调控性非编码RNA相关数据库介绍(二)lncRNA:rbpdb、lncRNAdb、LNCipedia等circRNA:circBase、CircInteractome、circRNADb等12:00-13:30午饭及午休13:30-15:00外泌体与调控性非编码RNA外泌体概述外泌体分离方法外泌体检测方法外泌体常用数据库外泌体与miRNA、lncRNA、circRNA研究案例分析15:00-15:20茶歇15:20-17:30解读标书及答疑解读并分享6份近三年非编码RNA(lncRNA,circRNA,外泌体)相关国自然标书现场答疑讲师简介孙教授,是较早获得circRNA相关国家自然科学基金面上项目立项的专家之一,长期专注于miRNA、lncRNA、circRNA等调控性非编码RNA研究,具有扎实的理论基础和丰富的实验技能,精通研究策略与研究技术,发表高水平学术论文多篇。孙教授专注于调控性ncRNA研究十余年,长期活跃于科研一线,熟悉调控性ncRNA的研究现状和研究策略,具有扎实的理论基础和丰富的实验技能。主持承担10余项miRNA、lncRNA和circRNA等ncRNA相关科研项目(包括2项国家自然科学基金);发表学术论文20多篇,单篇最高他引120多次(年均他引20余次)。作为医药加学习班的签约讲师,已经在北京,上海,太原,大连,西安,昆明,广州开过28期学习班,场场获得广大学员的一致好评,打分在9.5分以上!被学员评价为是既有idea, 又很懂技术的教授!孙教授的讲课特点是:理论深入浅出,技术讲解环环相扣,套路讲解很接地气,从基础理论到相关技术,再到研究套路都能讲地很细致到位,无论你是想要1-3分,还是3-5分,或者是8分以上的文章,都有相关的研究套路来教你如何一步一步实现。本次研讨班围绕以上主题进行设计,只要您是从事医学、动物、植物等生命科学领域,通过参加此次学习班,有助于快速熟悉调控性非编码RNA与外泌体领域得研究策略与研究技术,缩短发表SCI论文、获得研究基金的周期。孙教授获得2019年医药加学习班金牌讲师称号!
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