TCGA miRNA数据挖掘文章分享

文章题目：Seven protective miRNA signatures for prognosis of cervical

cancer

文章链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Seven+protective+miRNA+signatures+for+prognosis+of+cervical++cancer

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文章摘要：

宫颈癌是20多岁和30多岁女性癌症死亡的第二大原因，但对其预后的研究却很有限。本研究旨在鉴定与预后相关的miRNA并研究其功能。宫颈癌患者的TCGA数据用于建立具有单一临床参数或miRNA表达水平的单变量Cox模型。多变量Cox的模型是使用两者建立的临床信息和miRNA表达水平。最后，STRING用于GO富集分析和Pathway富集分析，用于验证重要miRNA的靶基因，并可视化它们之间的相互作用。使用单变量Cox模型与临床参数，我们发现两个临床参数，烟草使用和临床阶段，和七个miRNA与生存状态高度相关。仅使用miRNA特征的表达水平，该模型可以成功地将患者分为高风险和低风险组。基于两个临床参数和七个miRNA提出了最佳特征选择模型。这七种miRNA的功能分析显示它们与癌症相关的各种途径相关，包括MAPK，VEGF和P53途径。这些结果有助于确定靶向治疗靶点的研究，这可能有助于为宫颈癌患者量身定制治疗方案。