从一篇研究肥胖的4.433分的SCI文章里,能学到点啥?能学到PubMed文本挖掘的干货……

其实刚开始并没有想要找什么文献分析工具

,其实是在夏老师随便翻PubMed的时候,发现了这篇研究肥胖的文献:

斤两十足 许冠杰 - 大串烧1

这篇虽然是肥胖研究的文献分析,但居然也发到了J Pers Med (IF: 4.433)上,说明并不算是特别低端了。于是夏老师就瞄了一眼

。这篇文献主要讲的,就是从两个文本挖掘工具入手

,做了肥胖相关的文献分析:

这工具就是这,主要是用来通过PubMed

,来进行分析文献MeSH词的词频和相关性的:

随便搜个“肥胖”,然后选择其中的2000个MeSH词结果

,只返回其中的2000个结果:

选择相关需要分析的文献,这个过程中可以对挖掘的文献进行剔除

,就剔掉那些让人看着不满意的:

剩下的,

就进行MeSH词的分析:

不光是挖掘文献本身的MeSH词,

也可以通过文献的摘要进行进一步挖掘:

获得的MeSH词结果,

理论上能进行具体的NetWork分析:

文献里是这么说的,

人家做出来的Figure就蛮好看:

但是,我就一直卡在这一步上

……不停转圈……

直到使用了个小工具,狗急了一下

,终于点进去了……

确实,能对于MeSH词进行具体的关联分析

……点击各个Node,也能看到具体的文献,以及摘要:

其实文献也都有链接,查询起来更容易点了

……有兴趣的话,就自己挖挖感兴趣的课题吧…… 好了,要看这篇文献,可以自己去PubMed上下搜一下。实在不行就回复“公克”(不要在评论区回复

),要么就直接星球上见(当然,进不去也无所谓

)。好吧,今天就先给你们策到这里吧,祝你们心明

眼亮

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