推荐：江舜尧
编译：莫沉
编辑：小菌菌
爱尔兰科克大学微生物系PaulW. O’Toole教授团队于2019年11月24日在《Gastroenterology》上发表题目为《Differences in Fecal Microbiomes and Metabolomesof People With vs Without Irritable Bowel Syndrome and Bile Acid Malabsorption》的文章。该研究发现IBS患者的肠道微生物组成与对照组不同，并反映在粪便代谢物中。尽管IBS症状存在异质性，但与对照组相比，患者的尿液和粪便代谢体以及粪便微生物组存在显著差异，且与IBS的症状亚型无关。该研究表明，粪便微生物组和代谢组的分析可以区分有无肠易激综合征、有无胆汁酸吸收障碍的患者，上述发现为用于开发基于微生物的IBS的治疗策略提供了参考。
文章摘要
肠易激综合征(Irritable bowel syndrome, IBS) 作为一种异质性疾病，其诊断和亚型的确定通常要基于患者具体症状而定。在本实验中，研究者分析了IBS患者和非IBS患者的粪便微生物群落，以确定这种疾病的生物标志物。本研究共收集了80名IBS患者(RomeIV criteria; 年龄16-70岁)和65名匹配的非IBS患者(对照组)的粪便和尿液样本，以及常规的医学和饮食信息。分别对上述粪便样本进行Shotgun和16S rRNA扩增子测序，并对尿液和粪便代谢物进行气相色谱和液相色谱-质谱联用分析。基于数据之间显著的Spearman相关性生成同现网络，同时通过对放射标记的硒-75牛磺胆酸，确定腹泻患者存在明显的胆汁酸吸收不良(Bile acidmalabsorption, BAM)。与对照组相比，IBS患者在饮食和粪便微生物之间的网络关联上有显着差异，同时都伴随着粪便代谢物的差异。此外，研究者并未发现不同IBS症状亚型患者的粪便微生物组成有显著的差异，而粪便样本的代谢谱则可以较好地区分IBS患者和对照组。尽管尿液代谢物在IBS患者和对照组之间也有显著差异，但大多数差别代谢物与饮食或药物有关。粪便代谢组，而不是微生物组，可以显著区分患者IBS有和没有BAM症状。尽管IBS具有较高的异质性，但患者的尿液和粪便代谢物及粪便菌群与对照组有着显著的差异，且与IBS的症状亚型无关，同时粪便代谢组分析可用于区分有无BAM的IBS患者。上述研究可用来开发基于肠道微生物的针对IBS的治疗策略。本研究表明，IBS患者的肠道微生物组成与对照组不同，并反映在粪便代谢物中。然而，宏基因组和代谢组构型并不能有效区分IBS的临床亚型(IBS-C，-D，-M)。同时，研究者还发现，患有胆汁酸吸收不良的IBS-D和IBS-M患者的粪便代谢物发生了改变，可以在不需要SeHCAT(75 Selenium (Se) homocholic acid taurine)检测的情况下区分这些患者。对饮食-微生物-代谢轴的综合分析显示，与对照组相比，IBS患者的饮食成分与肠道微生物的相互作用，并揭示了一组不同的粪便代谢物，这些代谢物可能驱动或延续IBS综合征。
文中重要图片说明：
图1 |对照组和肠易激综合征组的微生物组成分析
图2 | SeHCAT检测受试者胆汁酸吸收不良的分布、微生物组和代谢组谱
图3 |对照组与肠易激综合征尿液和粪代谢产物的比较分析
图4 |跨多个基因组数据集的结构和共丰度的可视化分析
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