一站式进化分析

我们在做多基因x分析的时候，有时候会做需要对多个基因进行序列匹配来查看其序列之间的相似性，观察不同基因之间的序列的进化关系。前几天我们介绍了如何利用mega来构建进化树：进化树构建的基本过程（上）进化树构建的基本过程（下）。这一次我们就介绍一个一键构建进化树同时可以绘制进化树的网站：NGPhylogeny.fr (https://ngphylogeny.fr/)，这个数据库包括了现在主流的一些进化分析的软件，过自己选择使用哪个软件来完成一键式的进化分析。

这个数据库分成三个模式：

One Click: 软件和参数默认来进行进化分析。

Advanced: 软件默认，各个软件的参数自己来选择。

A la Carte: 自定义软件+自定义参数。

PART1

输 入

我们使用One Click来进行演示。在这个一站式分析里面我们只需要选择自己想要分析的流程即可，不同的流程之间的区别只是在于Tree Inference使用的软件不同而已。

我们需要做的就是上传或者输入fasta数据就行。输入完fasta的序列之后 ，点击Submit即可。

PART2

输 出

经过一段时间的分析后，我们可以得到各个软件的分析结果。

对于每个软件的分析结果，数据库也是提供了数据下载和查看的地方，例如对于整体单个氨基酸比对的结果。

另外，这个数据库还提供了一个外部链接到 iTol 的网站，这个网站可以用来自定义进化树。

通过这个网站。我们可以进一步的自定义自己的进化树。来画出更好看的进化树结果。