肿瘤细胞系多组学数据库

对于肿瘤细胞系的分析，之前我们介绍过 。但是随着CCLE系统的升级。之前介绍的一些功能基本上也用不了。按照之前的帖子，我们在进入CCLE网址之后，界面变成了下面的这个样子。所以为了更好的时候使用CCLE数据库，这里我们就重新来做一个新版本的 CCLE 使用教程吧。

数据下载

在新的网站当中，我们可以点击 DATASETS 来查看 CCLE 当中的具体都有哪些数据。

可以看到在 CCLE 当中除了每个细胞系的基本表达数据。还有各个细胞系的基因组数据，基因融合数据，表观遗传数据以及组蛋白修饰数据甚至代谢组的数据都有。

至于数据的下载，我们可以点击 CCLE data就可以看到 CCLE 当中的具体数据了。

数据的下载，主要是通过 DepMap 这个数据库来进行下载了。这个里面除了包括 CCLE 的数据。还包括了其他的一些细胞系相关的组织的数据。

想要什么数据，直接进行关键词筛选即可。

以上就是 CCLE 的基本数据和数据下载的方法。至于说数据在线分析的话。官方推荐了三个工具：DepMap ，CLiFF以及cBioPortal。

对于这三个工具，CLiFF，我们并没有找到相对应的信息。另外一个cBioPortal 我们在之前的[[cbioPortal-TCGA多组学分析数据库]]当中介绍过它的用法。具体的不同也就是把其中分析的数据集变成CCLE即可。所以这里也就不做过多介绍了。

关于 DepMap portal 这个，由于东西比较多，所以可以关注一下我们明天的推送哈