食道微生物，下一个热点？Cell子刊：小心'坑'！ | 热心肠日报
今天是第1935期日报。
Cell子刊：食道微生物组——新焦点还是炒作？（观点）
Trends in Microbiology[IF:17.079]
① 微生物组研究是当下焦点，但话题过热也会带来“炒作”风险，在探索食道微生物组这类我们还知之甚少的领域时，尤需谨慎；② 食道具有丰富的微生物群落，有研究表明食道微生物组与食管反流疾病、食道癌相关；③ 但由于技术限制、食道样品易受口腔污染等，食道微生物组详细图谱尚不清晰，缺乏直接的细菌与食道病理间联系的研究；④ 高通量培养组技术、宏基因组组装基因组的应用等，使食道微生物组在生理病理中的研究得到了进一步发展。
The oesophageal microbiome and cancer: hope or hype?
09-04, doi: 10.1016/j.tim.2021.08.007
【主编评语】Trends in Microbiology近期发表的观点性文章，讨论了食道微生物组潜在的重要性和新的方法论，包括培养组学、宏基因组学和全基因组序列的恢复等。文章结尾提了12个关于食道微生物组如何研究，研究什么的Outstanding questions，非常值得思考。（@solo）
Nature子刊：靶向抑制肠道钟基因Bmal1抑制肥胖
Nature Communications[IF:14.919]
① 肠道特异性缺失Bmal1基因的小鼠（Bmal1iKO 小鼠）在普通饲料喂养中具有正常表型，而在高脂饮食中，Bmal1iKO小鼠可免受肥胖和相关代谢异常的发展如高脂血症和脂肪肝；② 一致地，在野生型小鼠中，与随时进食小鼠相比，在夜间（BMAL1表达较低）喂养高脂饮食的小鼠肥胖有所减轻，靶向抑制BMAL1也可改善高脂诱导的肥胖；③ 机制上，BMAL1通过直接结合启动子中的E-box 反式激活Dgat2基因（编码三酰甘油合成酶 DGAT2），从而促进膳食脂肪吸收。
Deficiency of intestinal Bmal1 prevents obesity induced by high-fat feeding
09-07, doi: 10.1038/s41467-021-25674-5
【主编评语】近期广州中医药大学中药学院分子节律与代谢研究所吴宝剑与深圳市人民医院刘凯胜作为共同通讯作者在Nature Communications发表的一项研究表明肠道钟基因 Bmal1通过调节Dgat2转录和表达促进膳食脂肪吸收，靶向抑制肠道Bmal1可保护小鼠免受高脂饮食诱导的肥胖，这些发现表明肠道BMAL1可作为治疗过量脂肪摄入引起的代谢性疾病的药物靶点。（@临床营养Dr.Chen）
Lancet：一文读懂慢性肾病的管理（综述）
Lancet[IF:79.321]
① 慢性肾病保守治疗和保肾护理目的是减缓慢性肾病进展，延长无透析时间，提高生活质量和生存率；② 低蛋白低盐的植物性饮食可减轻肾小球过度滤过、保护肾功能、维持酸碱稳态并调节肠道菌群；③ 药物治疗可通过降低肾小球内压、抗炎或抗纤维化等机制保护肾功能；④ 管理慢性肾脏病的心血管风险，降低感染风险和预防急性肾损伤是慢性肾病的关键干预措施；⑤ 当肾脏替代治疗不可避免时，可以考虑逐渐过渡到透析，并尽可能延长残余肾功能的保留。
Chronic kidney disease
06-24, doi: 10.1016/S0140-6736(21)00519-5
【主编评语】来自Lancet上发表的一篇综述文章，详细介绍了慢性肾病的管理方式，包括非药物干预（饮食及生活方式干预）及药物治疗。（@aluba）
香港大学张彤 Nature子刊：基于组学的抗生素耐药基因风险评估框架
Nature Communications[IF:14.919]
① 依据抗生素耐药基因（ARGs）在人类相关环境的富集度、基因移动性和宿主致病性为主要因素开发了ARGs风险等级的评估框架，将ARGs分为四个风险等级；② ARGs广泛存在，与环境无关，仅有30%ARGs与抗生素使用相关；③ 3.6%的ARGs属于当前或未来威胁的高风险（一、二级）ARGs；④ 鉴定了73个一级ARGs，35个为已知高风险ARGs，另外新发现的38个ARGs具有显著的临床相关性；⑤ ARGs广泛存在于正常人的肠道菌群中，但仅有8.9%的基因组中包含高风险ARGs。
An omics-based framework for assessing the health risk of antimicrobial resistance genes
08-06, doi: 10.1038/s41467-021-25096-3
【主编评语】病原微生物的抗生素耐药性已经成为威胁人类健康的关键因素。抗生素耐药基因（ARGs）是微生物耐药的主要机制，ARGs广泛存在于自然界中，然而并不是所有的ARGs都会威胁公共健康。因此，如何有效识别和评价潜在的高风险ARGs对于人类有针对性的开展主动预防具有重要的意义。近期国内香港大学张彤团队在Nature子刊，Nature Communications上发表了他课题组最新的研究成果，他们基于组学的信息成功开发一套崭新的ARGs评估框架，该框架以抗性基因是否高度集中于与人类相关的环境中、在微生物种间的可转移性，以及在宿主（人类）内的可致病性为主要因素，将ARGs按照风险程度分成了四个级别，系统地评估了ARGs对人类所构成的风险。（@Zhonghua）
在不同种族中，肠道菌群与NAFLD的关联
Gut Microbes[IF:10.245]
① 纳入1544名60-77岁的受试者，其中511名NAFLD患者，对肠道菌群进行分析；② NAFLD与肠道菌群α-多样性的关联受到种族影响，在黑人、白人及拉丁美洲人中，NAFLD患者的肠道菌群α-多样性显著降低；③ 鉴定出62个菌属与NAFLD相关，鉴定出69个菌属至少在一个种族中与NAFLD相关，未鉴定出任何一个菌属在所有种族中均与NAFLD相关；④ 在所有种族中，均可观察到次级胆汁酸及碳水化合物相关通路与NAFLD相关。
Associations of the gut microbiome with hepatic adiposity in the Multiethnic Cohort Adiposity Phenotype Study
09-07, doi: 10.1080/19490976.2021.1965463
【主编评语】肠道菌群可能促进非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的发生发展。Gut Microbes上发表的一项最新研究，纳入了1544名不同种族（黑人、白人、拉丁美洲裔、日裔、夏威夷原住民）的老年受试者（其中511名NAFLD患者），发现NAFLD与肠道菌群多样性、组成及功能相关，而这种关联受到了种族因素的影响。（@aluba）
芳香烃受体介导了肠道菌群对小鼠行为的影响
Brain Behavior and Immunity[IF:7.217]
① 抗生素处理增加小鼠的盲肠重量，在高架十字迷宫 (EPM)、露天试验（OFT）和三室实验（3CT）中，对焦虑样行为、运动或社交偏好并无显著影响；② 在悬尾测试（TST）及强迫游泳测试（FST）中，抗生素处理可减少雄性小鼠的静止时间，停用抗生素后该表型可逆转；③ 在芳香烃受体敲除小鼠中，也可观察到相似的绝望行为的增加；④ β-萘黄酮激活肝脏和海马体中的芳香烃受体表达，并改善抗生素处理后的雄性小鼠的绝望行为。
Behavioural adaptations after antibiotic treatment in male mice are reversed by activation of the aryl hydrocarbon receptor
08-27, doi: 10.1016/j.bbi.2021.08.228
【主编评语】Brain Behavior and Immunity上发表的一项最新研究，发现抗生素处理或敲除芳香烃受体，均可在悬尾实验及强迫游泳实验中，增加雄性小鼠的绝望行为，而激活芳香烃受体可逆转这一表型。（@aluba）
地中海饮食践行者认知与体重降低的关联性
Clinical Nutrition[IF:7.324]
① 将在基线时存在超重/肥胖，但认知功能正常的487人（平均65.2±4.7岁）分配至能量限制性地中海饮食+运动促进的干预组和非能量限制地中海饮食对照组；② 干预组在基线时言语记忆、反应时间和决策能力方面表现较好的个体，达到8%减重目标的几率更高，而对干预方案依从性更高者与记忆力改善更多有关；③ 认知的更多提升与BMI的更大降低以及身体活动和生活质量的更好改善相关；④ 认知改善的个体差异与对干预依从性、性别年龄及基础病等因素有关。
Interplay between cognition and weight reduction in individuals following a Mediterranean Diet: Three-year follow-up of the PREDIMED-Plus trial
08-05, doi: 10.1016/j.clnu.2021.07.020
【主编评语】近期发表于Clinical Nutrition的一项研究表明更好的遵循限制能量性地中海饮食（限制30%能量）＋运动促进的生活方式干预方案与更好的认知改善有关。（@临床营养Dr.Chen）
武汉协和医院：低FODMAP饮食可改善IBS患者的总体症状及排便习惯
Frontiers in Nutrition[IF:6.576]
① 纳入10项随机对照试验（共涉及511名IBS患者）进行荟萃分析，总结低FODMAP饮食对IBS患者的作用；② 与对照干预相比，低FODMAP饮食与IBS患者的总体症状改善（n=420）、排便习惯改善（n=434）、排便频率降低（n=434）相关，证据质量中等；③ 低FODMAP饮食对IBS患者的生活质量（n=484）、焦虑（n=150）、抑郁（n=150）及BMI（n=110）无显著改善作用，证据质量低或极低。
A Low-FODMAP Diet Improves the Global Symptoms and Bowel Habits of Adult IBS Patients: A Systematic Review and Meta-Analysis
08-19, doi: 10.3389/fnut.2021.683191
【主编评语】华中科技大学同济医学院附属协和医院的侯晓华团队与Lei Zhang团队在Frontiers in Nutrition上发表的一项荟萃分析结果，总结了10项随机对照试验（共包含511名受试者）的数据后发现，低FODMAP饮食可显著改善IBS患者的总体症状、排便习惯及排便频率。（@aluba）
人体肠道菌如何转化胆汁酸？
mSystems[IF:6.496]
① 评估72株人类肠道细菌，表明不同菌株转化初级胆汁酸（胆酸、鹅脱氧胆酸）和次级胆汁酸（脱氧胆酸）的效率不同；② 表现出3a-、7a-或12a-羟基类固醇脱氢酶（HSD）相对活性和特异性的胆汁酸转化菌，分别有25株、38株、12株；③ 其中7a-去羟基化活性分布在多个细菌属，同时也发现了C-6和C-7的羟基转化；④ 结合初级和次级胆汁酸的氨基酸在肠道微生物中广泛存在，同时发现了44种新的微生物共轭胆汁酸。
Dominant Bacterial Phyla from the Human Gut Show Widespread Ability To Transform and Conjugate Bile Acids
08-31, doi: 10.1128/mSystems.00805-21
【主编评语】肠道细菌通过化学修饰宿主合成的初级胆汁酸，即次级胆汁酸，可作为信号分子，调节宿主的脂质、葡萄糖和能量代谢，并通过选择性抗菌特性影响肠道微生物组成。然而，目前还不足以预测某一特定微生物如何影响胆汁酸代谢，从而影响宿主生理。mSystems最近发表的文章，对人体肠道中常见的72种细菌的胆汁酸转化能力进行了系统的体外研究。结果发现肠道细菌具有广泛的转化和结合胆汁酸的能力，同时也确定了新的结合次级胆汁酸。本研究结果或可有助于更好地了解肠道微生物群是如何影响胆汁酸池的。（@nana）
感谢本期日报的创作者：solo，临床营养Dr.Chen，徐硕，周云燕，aluba，Johnson，Jack Chen