一文搞定R包安装报错

R包安装报错是一件很头痛的事情,因为包安装不了,后面的分析都无法完成了。其中R包报错最常见的就是bioconductor上的包,有很多粉丝最近都问到这个问题,所以在这里讲一下。

报错问题

在安装bioconductor上的包时候,大家可能往往会将多个包一起安装,例如像这样:

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")

biocLite("limma")

biocLite("impute")

biocLite("pheatmap")

这样一起安装一般都会报错,下面我们可以试试看,直接将上面的代码复制到R,然后看看会有什么样的结果

出现了如下的结果:

后面的包无法安装了,你这时候在按回车是这个反应:

Update all/some/none? [a/s/n]:

Update all/some/none? [a/s/n]:

Update all/some/none? [a/s/n]:

接下来,我们来看解决方法。

解决办法

遇到这种情况,我们输入一个n就可以了。

我们在安装bioconductor包的时候,先将第一个安装好,后面的可以一起安装,

例如这样:

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")

biocLite("limma")

有时候,没有出现上面这种情况,安装时也报错,我们要检查一下是source("http://bioconductor.org/biocLite.R")这里网址有没有错,如果检查完都没有错的话,我们可以是在http加多一个s试试,这样子:

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")

biocLite("limma")

本次分享就到这里,希望对大家有所帮助。

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