怎样选择(设计)测序用引物?

测序用引物要求非常严格,不同于PCR用引物。PCR用引物一般只要能和模板结合,3' 端的几个碱基能完全配对,即使引物长达80~100多个碱基,只要调整PCR反应条件,也能成功进行PCR反应。

而测序用引物便不一样了,必须严格符合以下要求。本公司的测序用引物全用引物设计软件Oligo设计。在本公司测序时,我们可免费帮助设计测序用引物。。

●长度在15~25个碱基左右,一般选择20个碱基(根据GC含量做适当调整),3' 端尽量选择G或C碱基 (但不绝对),以增加与模板的结合能力。

●Tm温度应选择50℃~70℃左右。

●GC含量应选择在50%左右,尽量避开A、T、G、C的连续结构。

●避开引物自身形成发夹结构或引物二聚体结构等复杂结构。

●保证引物和模板100%匹配,特别是3'端的几个碱基一定要100%匹配。同时必须严格保证引物和模板之间只能有一个结合位点。

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