Omics精进07|转录组之mRNA|miRNA|lncRNA|circRNA测序简介 / 四六文摘

非编码RNA(Non-coding RNA)是指不编码蛋白质的RNA,包括miRNA.lncRNA.circRNA.piRNA等.非编码RNA发挥功能的方式很多,可以与蛋白.DNA和RNA相互作用,参 ...

SomamiR是microRNA(miRNA)及其靶点中癌症体细胞突变的数据库,集成了多种类型的数据,用于研究体细胞和种系突变对癌症中miRNA功能的影响.数据库还提供了存在miRNA靶序列体细胞突变 ...

RNA按照能否编码蛋白可分为:编码蛋白的RNA和非编码RNA.(百度百科:RNA可根据结构和功能的不同分为信使RNA和非编码RNA.) 我们之前高中阶段学到的信使RNA(mRNA).转运RNA(tRN ...

"胡,starbase是干嘛的?" "不就是预测miRNA与mRNA结合的数据库嘛." "还有呢?" "......" ...

编译:思越,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读心血管疾病(CVD)主要包括高血压(HT),冠状动脉疾病(CAD)和心力衰竭(HF)等,是发达国家成年人发病和死亡的主要原因.交感神经 ...

虽然我一直讲解的GEO数据挖掘,都是基于mRNA这样的表达芯片,但实际上miRNA,lncRNA,甚至circRNA芯片也是大同小异的分析流程. 所以,如果你确实是第一次接触circRNA芯片数据,完 ...

大家好,今天和大家分享的是2020年2月发表在Aging(IF=4.831)上的一篇文章:Cancer stem cell-specific expression profiles reveal em ...

转录组测序背景简介狭义的转录组默认只包含mRNA,但是广义的转录组指的是细胞或组织中所有转录产物的集合,其中包含mRNA和非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA).非编码RNA目前 ...

本篇我们将介绍miRNA与mRNA结合预测.LncRNA与miRNA结合预测.LncRNA与蛋白RNP结合预测相关内容一.miRNA与mRNA结合预测 miRNA是非编码调控小分子,通过抑制基因表达 ...

本文介绍「mRNA测序文库」构建. ❞ mRNA文库构建主要步骤如下, 详细一点,左边为构建过程,右边为质控过程. total RNA提取上图黄色为残留DNA,DNA酶即可消化. total RNA ...

本文介绍「mRNA生信分析流程」 ❞ mRNA生信分析速览 mRNA生信分析主要包含以下各部分. mRNA分析详细步骤数据质控及过滤 FastQC数据质控关注测序数据的碱基质量.GC比等,见上图红 ...

编译:雪源,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读疫苗是医学领域最伟大的成就之一,它大大降低了人类许多重大传染病的死亡率和发病率.然而对疫苗介导的保护机制的理解仍然不完善.新兴的系统 ...

响应生信技能树的号召:lncRNA数据分析传送门 , 一起来一个lncRNA数据分析实战! 往期目录 lncRNA实战项目-第二步-了解文章及数据 lncRNA实战项目-第三步-了解参考基因组及注释文 ...

导语今天和大家分享的是OncoTargets and Therapy 杂志(IF=3.34)上的一篇文章,"Potential Prognostic and Diagnostic Valu ...

4种策略简介 whole-genome sequencing (WGS).whole-exome sequencing (WES).targeted-panel sequencing(Gene pan ...

本文目录国外泛癌Panel产品国内癌种小Panel产品 Panel长啥样 Panel关键参数 Panel设计 reference 国内外泛癌Panel产品「获FDA批准」,目前仅有以下三个泛癌p ...

胚系突变(Germline Mutation)和体细胞突变(Somatic Mutation)在WES.WGS.Gene Panel检测时常常遇到,二者最大的区别是「胚系突变可以遗传给后代,而体细胞突 ...

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