茶树自噬相关基因（CsARGs）家族研究

Genome-wide identification, characterization, and expression analysis of tea plant autophagy-related genes (CsARGs) demonstrates that they play diverse roles during development and under abiotic stress

*BMC Genomics

背景

自噬是指“自食”，是在压力和非压力条件下细胞质成分的降解和再循环所必需的，这有助于维持细胞稳态并延缓真核生物的衰老和寿命。迄今为止，在酵母，哺乳动物和模型植物中已经对自噬的功能进行了大量研究，但是很少有研究集中在具有经济意义的农作物上，尤其是茶树。迄今为止，自噬在应对各种环境刺激中所起的作用尚未完全阐明。因此，研究茶树中自噬相关基因的功能可能有助于阐明控制木本植物对逆境的自噬机制。

结果

在这项研究中，我们确定了35个自噬相关基因（CsARG）。除了CsATG14以外，每个CsARG与其他植物物种的同源物都高度保守。组织特异性表达分析表明，不同组织之间CsARG的丰度不同，但是CsATG8c / i显示出一定程度的组织特异性。在激素和非生物胁迫条件下，大多数CsARG在治疗期间的不同时间点被上调。此外，表达水平为10 CsARG在CA时期，抗寒品种'Longjing43'的耐盐性高于易感品种'Damianbai'。然而，CsATG101的表达却呈现相反的趋势。

结论

我们对茶树中CsAR Gs进行了全面的生物信息学和生理学分析，这些结果可能为进一步研究研究控制茶树生长，发育和对压力的自噬的分子机制奠定基础。同时，在未来的研究中，一些CsARGs可以作为抗寒茶树育种的推测分子标记。