PARP抑制剂“新搭档”——DNPH1抑制剂 | Science里程碑

PARP全称为poly(ADP-ribose) polymerase,即多聚ADP核糖聚合酶,参与了包括DNA修复等在内的一系列细胞过程。自2014年以来,已有5款PARP抑制剂(奥拉帕利、鲁卡帕尼、尼拉帕利、他拉唑帕尼、氟唑帕利)获监管机构批准上市,2020年这类药物的全球市场规模为23.78亿美元。

PARP抑制剂最显著的是用于治疗携带BRCA突变的卵巢癌和乳腺癌患者。BRCA主要利用同源重组的高保真机制修复双链DNA断裂,而对于存在BRCA1或BRCA2突变的肿瘤,因为BRCA蛋白失活,肿瘤细胞内的DNA损伤修复将更加依赖于PARP。如果使用药物让PARP的活性进一步受到抑制,那么肿瘤细胞分裂时就会产生大量DNA损伤,导致细胞死亡,从而阻止肿瘤的生长。

然而,一个不可忽视的问题是,尽管PARP抑制剂带来了生存获益,但并不是所有携带BRCA1/2突变或其它同源重组缺陷的癌症患者都能响应PARP抑制剂,且在很多时候,一些最初响应PARP抑制剂的患者通常也会发展出耐药性。寻找新的方法在这种耐药性产生之前有效地杀死癌细胞,或使癌细胞对治疗重新变得敏感(re-sensitize),对于改善患者的生存至关重要。

来源:Science

4月9日,来自英国Francis Crick研究所的一个科学家小组在Science杂志上发表了一项里程碑进展,他们发现,通过阻断一种名为DNPH1的蛋白来干扰核苷酸代谢可以增加肿瘤对PARP抑制剂的敏感性。研究表明,“DNPH1抑制剂联合PARP抑制剂”有望改善某些乳腺癌患者的治疗。

具体来说,在该研究中,科学家们对单倍体人类白血病细胞进行了全基因组功能缺失筛选,以识别影响癌细胞对PARP抑制剂奥拉帕利敏感性的基因。结果发现,参与核苷酸代谢的基因——DNPH1(2′-deoxynucleoside 5-monophosphate N-glycosidase)能够增强奥拉帕利的细胞毒性。

DNPH1缺失使同源重组缺陷细胞对PARP抑制剂敏感(来源:Science)

阻断DNPH1蛋白会使BRCA缺陷的癌细胞对PARP抑制剂产生敏感性,导致癌细胞死亡。重要的是,研究还证实,当DNPH1被阻断后,已对PARP抑制剂产生耐药性的细胞也能够被杀死,且这种联合治疗并不会影响健康细胞。这些发现表明DNPH1是未来药物开发的一个有希望的靶点,有望与PARP抑制剂联合,加速杀死BRCA突变癌细胞。

从核苷酸池中移除hmdUMP:DNA中的5-羟甲基-胞嘧啶(5-hydroxymethyl-cytosine,hmC)以游离核苷酸5-羟甲基-脱氧胞苷单磷酸(hmdCMP)的形式释放出来,之后脱氧胞苷酸脱氨酶(DCTD)又使hmdCMP脱去氨基,变成5-羟甲基-脱氧尿苷单磷酸(hmdUMP),hmdUMP最后被DNPH1裂解,导致其从核苷酸池中被移除(来源:Science)

在进一步的实验中,研究人员揭示了DNPH1的功能。原来,它是一种负责清除细胞毒性核苷酸5-羟甲基-脱氧尿苷(5-hydroxymethyl-deoxyuridine,hmdU)单磷酸(hmdUMP)的蛋白,起着“清道夫”的作用,可从用于构建DNA的核苷酸池中去除有缺陷的核苷酸,防止异常核苷酸编入DNA。

DNPH1是一种核苷酸“清道夫”,可水解hmdUMP,阻止其编入DNA(来源:Science)

而hmdU核苷和/或DNPH1抑制剂给药会导致hmdUMP在核苷酸池中积累,之后这种“垃圾“核苷酸就会被整合到DNA链中,导致DNA中含有5-羟甲基尿嘧啶(5-hydroxymethyluraci, hmU),以及尿嘧啶DNA糖基化酶1 (SMUG1)开始修复。而这种修复会产生导致复制叉崩溃和双链DNA断裂的脱碱基位点(abasic sites),之后又需要PARP进行修复。因此,DNPH1抑制剂疗法可增强PARP抑制剂的敏感性。

通过靶向DNPH1可杀死对PARP抑制剂耐药的BRCA1细胞(来源:Science)

该研究的一作兼共同通讯作者Kasper Fugger说:“通过研究DNPH1的功能并发现与之相互作用的分子,我们对该蛋白在细胞中的工作方式有了很好的了解。这些知识将帮助我们开发一种特异性抑制剂药物,从而更有效地杀死癌细胞。”

据悉,研究人员目前正在与制药公司合作开发一款DNPH1抑制剂,如果在临床试验中被证明是安全有效的,那么这类药物将有望作为PARP抑制剂的新搭档,一起用于癌症治疗。

总结来说,该研究证实,使DNA链中融入缺陷核苷酸(hmdU)是使细胞更容易受到PARP抑制剂影响的关键决定因素,而靶向DNPH1为使BRCA缺陷癌症对PARP抑制剂疗法变得更加敏感提供了非常有前景的策略。

Science杂志就该研究成果配发的PERSPECTIVE文章指出,这一发现为提高PARP抑制剂的有效性带来了新的途径,甚至可能为克服获得性耐药带来希望。

“PARP抑制剂为卵巢癌等癌症的治疗带来了里程碑进展,延长了许多人的生命,但患者对这类药物产生耐药的问题不可忽视。虽然还有很多工作要做,但是我们已经发现了一个非常有前景的PARP抑制剂'增强剂’——DNPH1抑制剂,期待这种新的联合治疗模式能够进一步改善患者治疗。“领导该研究的Stephen West说道。

参考资料:
1# 2020年全球热门靶点新药市场格局(来源:医药魔方)
2# Blocking a protein could help overcome cancer resistance to PARP inhibitors(来源:The Francis Crick Institute)
3# Kasper Fugger et al. Targeting the nucleotide salvage factor DNPH1 sensitizes BRCA-deficient cells to PARP inhibitors. Science(2021).
4# Epigenetic nucleotides enhance therapy(来源:Science)
5# 李敏杰等. DNA脱碱基位点的检测与应用.(来源:分析化学)

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