这是我们认为出SCI最快的方法
时不时有人问道:有没有比较简单快速发文的套路,就是不用代码的那种?我们的答案还是老样子,比较简单的发文套路就是Oncomine数据挖掘。下面我们来看一下这种套路。
Oncomine是什么?
Oncomine是大型肿瘤基因芯片数据库,涵盖65个基因芯片数据集、4700个芯片及4亿8千万个基因表达数据,可用于分析基因表达差异、寻找离群值、预测共表达基因等,并可根据肿瘤分期、分级、组织类型等临床信息进行分类,还可依据已知的基因—药物分析寻找可能的分子标记物与治疗靶点。
Oncomine里面有什么?
Oncomine囊括了19种癌症基因芯片数据,含有715个数据集,86733个样本,各样各样的分析。
Oncomine可以做什么?
基因差异表达分析
基因拷贝数变异分析
Meta分析
基因表达与临床相关性
基因共表达分析
Outlier分析
Concept分析
......
Oncomine数据挖掘套路
第一步,查看目标基因在哪些肿瘤中存在高表达(5分钟)
第二步,证明目标基因在某一肿瘤中是高表达的。(10分钟)
第三步,寻找共表达的基因。(5分钟)
第四步,确定目标基因在细胞系中是否高表达(5分钟)
第五歩,基因表达与生存的相关性(5分钟)
整一个分析流程只要30分钟就搞定了。我们在来对比一下meta分析,meta分析要文献检索,质量评价,数据提取,统计分析,就算你手脚再快,做个meta分析应该都要几天呢,然后我们再来看一下GEO,TCGA,专业的生信研究人员可以30分钟内完成GEO分析,但是TGCA应该不行,因为样本量大,有时候下载数据都要一两天,这是专业的生信研究员在程序方面没有任何问题才能有这样的速度。但是,对于不懂编程的人,那就要头痛了,只要有代码报错,你可能要找半天都找不出原因,然后到群里问,有人帮你解答还好,要是没有人帮忙解答,那整个分析不知道要到什么时候才能解决。