其实，GEO数据挖掘也很好发文章

GEO is a public functional genomics data repository supporting MIAME-compliant data submissions. Array- and sequence-based data are accepted. Tools are provided to help users query and download experiments and curated gene expression profiles. (GEO是一个公共功能基因组数据库，支持符合MIAME标准的数据提交。接受基于数组和序列的数据。提供工具以帮助用户查询和下载实验并策划基因表达谱。) 上面就是GEO数据库的介绍，GEO数据库与TCGA数据库相比有什么优势？

GEO数据库的优势如下：

1、肿瘤数据和非肿瘤数据也有（研究非肿瘤的福利）

2、数据更新速度非常快（数据由作者上传，而TCGA是政府项目）

3、有新东西（例如GEO有环状RNA，而TCGA没有）

GEO比较大的缺点就是没有什么临床数据，限制了数据挖掘的高度。

下面，我们就看看一篇GEO数据挖掘的文章做了什么内容：

1、差异分析

2、GO富集分析

3、KEGG分析

4、蛋白互作网络分析

一篇文章只需要这么多东西，非常简单，这样的文章也能发表两点几分的SCI。

参考文章：

Identification of differentially expressed genes and signaling pathways in ovarian cancer by integrated bioinformatics analysis