HPA数据库更新脑图谱、血液图谱与代谢图谱
HPA数据库全称The human protein atlas，即人类蛋白图谱，里面有许多关于蛋白研究的信息，如蛋白细胞内定位、在人体组织的表达情况，在肿瘤组织的表达情况等，如下图所示：
原来的HPA数据库主要包含组织图谱、细胞图谱与病理图谱，分别包含内容如下：
组织图谱： 某蛋白在机体不同组织脏器中的表达情况。
细胞图谱： 某蛋白在细胞内的定位情况，如核内、细胞膜上等。
病理图谱： 某蛋白在不同肿瘤中的表达情况。
最近，HPA数据库更新了脑图谱、血液图谱与代谢图谱，让我们一起来看看他们包含了哪些内容吧：
脑图谱
脑内最重要的功能单元就是神经元了，神经元的胞体和树突富含微观结合蛋白2 （MAP2），而轴突富含低分子量MAP，即tau蛋白。
我们以MAP2为例：
可以看到先是相关的介绍，这是一个脑组织富集的蛋白，与我们的背景知识相符合。
在人类不同脑区的表达量
在猪不同脑区的表达量
在小鼠不同脑区的表达量
人类脑免疫组化染色
小鼠脑免疫组化染色
全脑切片的免疫荧光，可放大看到每一个细胞
血液图谱
我们以白细胞标志物CD45为例，现在名为PTPRC
同样是基本信息，其中在所有血细胞（此处不包括红细胞）均检出与我们的背景知识相符。
可以看到血液图谱目前仅有RNA信息，没有蛋白信息。
不同数据集中表达情况，可以发现该基因在所有白细胞中均表达。
其余三类信息待补充。
代谢图谱
代谢图谱主要是手工整理了胞内的代谢通路，确定了各类代谢反应及其胞内定位，具体如下：
不同代谢通路，如组氨酸代谢和磷酸戊糖途径。
胞内不同部位，如线粒体、胞浆、内质网、核内等。
此处展示的是核内的代谢情况，还可转换成3D图：
似乎信息反而减少了
好了，本次推文就到这里，我们下次再见吧！
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