有趣病例39：灌洗液NGS（宏基因测序）诊断军团菌肺炎
常记溪亭日暮，沉醉不知归路。
云南 孙丹雄
小诗
春眠不觉晓，处处闻啼鸟。
公众号：小小医生之有趣的医学
临床现实中的病例，挺复杂的！
临床+CT+支气管镜+常规检查+各种奇怪的检查+动态观察病情，很多时候也未必能明确诊断！
01
系统性红斑狼疮患者，激素治疗数月后，高热，咳嗽！
什么情况？
02
初治
03 肿么办？
中华结核和呼吸杂志发表了《成人呼吸系统感染性疾病病原学诊断专家意见》！
宏基因组测序和16S rRNA基因测序
宏基因组测序（NGS）可覆盖几乎所有病原体（细菌、真菌、病毒、寄生虫等），但仍有一定缺陷：例如胞内菌感染（如结核分枝杆菌）因病原体或其核酸释放到体液中的含量较低，可能导致检测敏感度偏低（一旦测到，价值就很大）；对于某些真菌，其细胞壁较厚，破壁困难也可导致敏感度下降。
注意：宏基因组测序（NGS）结果，序列数高并不一定是致病原，序列数低也并非一定不是致病原，结果受标本中病原体数量、核酸提取量和测序数据量、标本中人源序列丰度等很多因素的影响，还是需要结合临床综合判断。
任何检查都有优缺点！
遂行支气管镜检查：支气管炎性改变，行支气管肺泡灌洗，查NGS！
NGS有点小贵，大约2000人民币，自费的！假如查到病原体，有时候可救命！孰是孰非，难以判断！
04
结果：军团菌、肺孢子菌！
军团菌序列数灰常高！
05
给予左氧氟沙星治疗军团菌，磺胺治疗肺孢子菌！
我觉得肺孢子菌肺炎未必是，影像学上不太像。估计病人治疗很久了都没有好转，输不起，也就用了！
06
效果如何？
治疗前
治疗后
治疗前
治疗后
治疗前
治疗后
07
治疗前
治疗后
治疗前
治疗后
08
治疗前
治疗后
09
美罗培南治疗，体温下降，考虑还是有其他G-杆菌感染可能！
军团菌（Legionella）是一种细胞内寄生的G-杆菌,可侵入人类肺泡巨噬细胞及其他巨噬细胞、肺泡上皮细胞和水生环境中的原虫中并寄生。
军团菌肺炎，有一半的患者很快呼吸衰竭！以前和道上的朋友交流，肺炎呼吸衰竭，呼吸机治疗，NGS查到军团菌，单用莫西沙星治疗好转。很棒的，气管插管的患者，单用莫西沙星治疗好转！非常不容易！
左氧氟沙星治疗明显好转，可临床诊断！
肺孢子菌肺炎，有可能！影像学不像，但是不典型的感染，影像学无用！
NGS，不可不信，也不能全信！
附录：
1977年美国费城首次暴发了军团菌肺炎(Legionella pneumonia),军团菌作为散发和流行性肺炎的主要病原体！
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杨柳岸，晓风残月。
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