新冠检测,如何控制核酸污染

来源:小桔灯网

临近春节,《冬春季农村地区新冠肺炎疫情防控工作方案》要求返乡人员需持7天内有效新冠病毒核酸检测阴性结果返乡,返乡后实行14天居家健康监测,期间不聚集、不流动,每7天开展一次核酸检测。此外,医院与食品检测机构也开展了场地、食品、外包装等的新冠核酸检测,以监控新冠传染途径。

在大规模新冠核酸检测中,出现了少量假阳性的误报。这些假阳性报告会给新冠监控带来错误的指导,一旦错误采取隔离/封闭措施,极大干扰相关企事业单位的正常运营检测前后及处理花费的人力和物力也浪费社会资源,挤占了原本可用于正确防控的资源。

这些假阳性结果大部分是由核酸污染造成的,其来源主要有:1、PCR产物污染;2、克隆质粒污染;3、样本污染;4、试剂污染。PCR会将极少量新冠基因进行指数复制,操作不当时,这些被大量增值的新冠核酸会以气溶胶形式被释放出来,污染整个实验室。在进行质粒克隆和抽提时,高浓度质粒容易以气溶胶形式污染实验室。采样样本处理/放置不当时,被其他样本或气溶胶污染。检测试剂生产或使用不当时,被气溶胶或其他方式污染。

见扩展阅读:美国CDC检测试剂盒污染;灭活病毒暴露污染样本;核酸检测气溶胶污染

核酸污染预防:
1、设置合理的实验室布局,一般可分为1)试剂准备区,2)样本制备区,3)核酸扩增区,4)产物分析区,qPCR这类不需要电泳分析的可将产物分析区与核酸扩增区合并。
2、每个步骤都在相应的实验区进行,每个区域内实验器材、物品不能共用,每个区完全隔离和独立通风,控制空气流动方向。如条件不足,也必须将扩增区和分析区与试剂准备和样本制备区隔离。最后废弃物处理区必须远离以上实验区。
3、实验人员、物料须严格单向流动,即只能从准备区到扩展区和分析区,避免产生交叉污染。
4、定期进行阴性质控检测,在大规模检测时,必须添加阴性样本,阴性对照品,无模板对照,保证出现污染时可立即发现。
5、使用封闭扩增的检测方法,如荧光定量PCR,并在扩增完成后不能打开试管。普通PCR和一些等温扩增方法需要开盖,很容易产生气溶胶污染。(Novoprotein 荧光定量PCR,Cat.E096/E094)
6、实验管理操作严格规范:在通风橱/超净工作台操作,实验前/后即时擦拭、清洁、消杀实验台,实验中使用一次性手套,如有污染可能,立即替换手套,移液枪吸取液体轻柔,轻轻吹打,避免飞溅,打开管盖时动作轻缓,漩涡震荡后,离心甩下液滴。使用带滤芯枪头,避免液体被吸入移液枪,所有实验物品尽可能提前分装成小包装,并预先灭菌和分装好。实验废弃物统一处理。

7、使用dUTP+UDG酶防污染体系:在PCR中使用dUTP部分代替dTTP,使PCR产物中掺入U。在第二次PCR扩增前,使用UDG酶处理PCR反应液,可打断上一次PCR产物中的U,使其无法污染第二次PCR扩增。(Novoprotein 热敏UDG,Cat.E063)

核酸污染处理:
发现核酸污染,立即暂停相关实验/检测,对实验场所、仪器设备进行彻底的清洁/消杀/去核酸处理,更换相关试剂、耗材,实验人员更换衣物并进行核酸去除。
常用的核酸污染去除方法有:紫外照射、酒精擦拭、通风等。紫外照射可打断核酸,但对打断小于200bp的片段效果不佳。酒精无法消化核酸,擦拭抹去表面核酸时容易残留。通风可将空气中气溶胶排出,但无法清除表面残留,而且需要很长时间。

因传统的核酸污染去除方法并不能完全去除核酸污染,《医疗机构新型冠状病毒核酸检测工作手册(试行)》指出,为避免气溶胶等核酸污染造成的检测假阳性,可采用核酸清除剂等试剂清除实验室残留核酸

Novoprotein核酸污染去除剂(Cat.M126)降解所有核酸,完全清除掉核酸污染:

使用不同方法去除核酸污染,再进行qPCR扩增检测,M126完全消除核酸

M126完全消除DNA及RNA

核酸污染是实验室、生产车间常见的污染事故,严重时会导致实验室、生产车间封停整顿。在新冠疫情之下,每一个核酸检测阳性都会被极度重视,并采取更严格的处理措施,一旦相关单位被检测出假阳性,将面临全面检测排查和停业整顿以及人员隔离检测,会严重影响相关单位的运营,也浪费了疾控中心、检测机构、排查/隔离/封锁单位的人力和物力。所以必须重视核酸污染,并且采取切实有效的手段预防、控制和处理核酸污染。

相关产品:

荧光定量试剂:E096/E094

热敏UDG酶:E063

核酸污染清除剂:M126

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