新冠检测,如何控制核酸污染
来源:小桔灯网
临近春节,《冬春季农村地区新冠肺炎疫情防控工作方案》要求返乡人员需持7天内有效新冠病毒核酸检测阴性结果返乡,返乡后实行14天居家健康监测,期间不聚集、不流动,每7天开展一次核酸检测。此外,医院与食品检测机构也开展了场地、食品、外包装等的新冠核酸检测,以监控新冠传染途径。
在大规模新冠核酸检测中,出现了少量假阳性的误报。这些假阳性报告会给新冠监控带来错误的指导,一旦错误采取隔离/封闭措施,极大干扰相关企事业单位的正常运营。检测前后及处理花费的人力和物力也浪费社会资源,挤占了原本可用于正确防控的资源。
这些假阳性结果大部分是由核酸污染造成的,其来源主要有:1、PCR产物污染;2、克隆质粒污染;3、样本污染;4、试剂污染。PCR会将极少量新冠基因进行指数复制,操作不当时,这些被大量增值的新冠核酸会以气溶胶形式被释放出来,污染整个实验室。在进行质粒克隆和抽提时,高浓度质粒容易以气溶胶形式污染实验室。采样样本处理/放置不当时,被其他样本或气溶胶污染。检测试剂生产或使用不当时,被气溶胶或其他方式污染。
(见扩展阅读:美国CDC检测试剂盒污染;灭活病毒暴露污染样本;核酸检测气溶胶污染)
7、使用dUTP+UDG酶防污染体系:在PCR中使用dUTP部分代替dTTP,使PCR产物中掺入U。在第二次PCR扩增前,使用UDG酶处理PCR反应液,可打断上一次PCR产物中的U,使其无法污染第二次PCR扩增。(Novoprotein 热敏UDG,Cat.E063)
因传统的核酸污染去除方法并不能完全去除核酸污染,《医疗机构新型冠状病毒核酸检测工作手册(试行)》指出,为避免气溶胶等核酸污染造成的检测假阳性,可采用核酸清除剂等试剂清除实验室残留核酸。
Novoprotein核酸污染去除剂(Cat.M126)降解所有核酸,完全清除掉核酸污染:
使用不同方法去除核酸污染,再进行qPCR扩增检测,M126完全消除核酸
M126完全消除DNA及RNA
核酸污染是实验室、生产车间常见的污染事故,严重时会导致实验室、生产车间封停整顿。在新冠疫情之下,每一个核酸检测阳性都会被极度重视,并采取更严格的处理措施,一旦相关单位被检测出假阳性,将面临全面检测排查和停业整顿以及人员隔离检测,会严重影响相关单位的运营,也浪费了疾控中心、检测机构、排查/隔离/封锁单位的人力和物力。所以必须重视核酸污染,并且采取切实有效的手段预防、控制和处理核酸污染。
相关产品:
荧光定量试剂:E096/E094
热敏UDG酶:E063
核酸污染清除剂:M126