从荒岛求生看公共数据库生信分析文章

最近一直沉迷于一个岛上生活的游戏，突然发现岛上求生的日子，其实和最近很多的利用公共数据库来挖掘生信文章很相似。因此也就像就着这个游戏来聊一下最基本的这类文章的分析思路。之后也就给大家来稍微的讲讲简单的生信分析流程吧！

 游戏中的生活 

一切都要从一座岛开始做起

游戏的一开始就是告诉我们，有一个无人岛移居计划。我们可以去一个无人岛上生存。我们需要做的就是只是来填写一下我们想要去的岛的名字。剩下的就会把我们送到那个岛上了。

到了一座岛上。首先还是要熟悉岛上的情况，知己知彼才能百战百胜，了解了岛上都有什么东西，这样才能知道自己能做什么。

人活着还是要有目标的

既然到了岛上了，那总不能躺着等死吧？还是要有一定的目标的。比如我要想钓鱼的话，我就需要鱼竿。那鱼竿的话，我就要在岛上找树枝。如果我想要做斧头的话，那我就需要树枝和石头了。这样我就可能需要两样东西了。

既然知道自己要做什么了，那接下来的任务就是找素材了。我想做鱼竿，那那我就找五个树枝就行。找到树枝，然后再需要一个工作台，然后一顿操作，就可以做出做出一个鱼竿了。

这样有了鱼竿，那我们就可以钓到鱼那就可以活下去了(其实，没有鱼竿我们也可以活下去)。。。

公共数据挖掘类的文章

游戏一开始的经历其实就是这么一个经历。为什么说前期这些经历和现在的生信套路文章很像呢？那你看我用这类想法的思路来重复上面的经历哈。

一切要从公共数据库开始说起

科研生活的一开始，就有人告诉我们有一个生信数据挖掘的方式。这个方式的第一步，是让我们去一个岛(公共数据库)上，这个岛有可能叫做GEO也有可能叫做TCGA。当然肯定不能叫cpg岛。

如果要好好的利用公共数据库，那就要彻底的了解这个数据库上都有什么东西。这样才能知道怎么这样才能知道以后可以去做什么研究。

科研还是需要一个方向的

在知道公共数据库使用的情况下，那我们得有一个研究方向。比如说：我们想要进行和胃癌有关的研究，那我们得先收集和胃癌发生有关的数据，找到了我们需要的数据然后才能进行下一步操作。

在找到所需要的数据之后，剩下的就是选择什么样的方式来进行分析了。等到确定分析方式了，那一顿操作就是一个生信相关的文章了。

写在最后

所以，其实一篇基础的生信文章还是很简单的。当然前提还是需要掌握一些软件和数据库怎么使用。这下来这几天呢，会给大家介绍一下基本的生信的一些概念和工具。希望大家能用到吧。明天就先给大家介绍，目前公共数据挖掘用到的最大的岛: GEO。

PS：欢迎玩动物之森的同学来我岛上做客