有着乔治克鲁尼的颜气质海明威的文艺范骨灰级男神,如今生信界的每个人都应该感谢他
今天咱们来聊个文艺范骨灰级生信科学家Jim Kent. 老规矩上照片舔屏先。
这位拥有乔治克鲁尼的颜+海明威气质的文艺Jim先生是生信界骨灰级的大神,算是生信界开天辟地的一位上神了, 十分了不起的风云人物。他的作品随便举个栗子吧: UCSC Genome Brower, BLAT。嘿嘿一股熟悉的感觉涌上心头有没有~
为何生信界的每个人都应该感谢他呢,这就牵扯上人类基因组计划那件大事了,别急,咱从Jim大神的出道聊起。
Jim1960年生于夏威夷,在旧金山长大。大神的编程生涯始于23岁,1983年Jim开始在Island Graphic Inc工作。当时Jim为Amiga家用电脑编写了一个能够结合3D渐变效果与2D简单动画的软件。1985年他干脆自己开了一家软件公司 Dancing Flame, 将之前自己写的动画程序创建成为一个汇集各种动画和绘画功能的程序Cyber Paint,为CAD-3D开发提供便利。这是是第一个允许用户跨时间制作压缩视频的软件。之后他还开发了软件Autodesk Animator用于个人电脑中,可以为各种视频游戏创作艺术作品。放张Jim大叔工作回眸帅照,戴着礼帽来编程,这艺术家逼格薄荷姐服气,明早就搭顶帽子去工作,指不定就有不一样的花火。
2000年Jim在攻读加州大学圣克鲁兹生物学博士学位时,写出了GigAssembler, 为了帮助人类基因组项目能够拼装和发布人类基因组序列。Jim开发这个软件初衷是自己和同事的研究需求,也出于对数据可能会被Celera Genomics 专利私有化的担心,因为当时竞争对手Celera 正在使用当时世界上最强大的民用超级计算机。为此,Jim Kent 与另一位大神UCSC的David Haussler迅速构建了一个由50台linux系统的商用个人电脑组成的实用集群来运行此软件。Jim的首个Assembly在当年6月22日在白宫发布,而Celera也在三天后6月25号白宫发布。UCSC的数据在7月7日就网上分享了。Jim在一个月时间内完成了正常至少10个程序员的工作,后来他被称为人类基因组计划的英雄。2002年Tim O'Reilly 形容Jim的工作是“去年开源开发最伟大的工作,没有之一”。 因为Jim所有的基因组学软件都是开源的,源代码可以免费下载和阅读,只要不是商业用途,所有软件都可以自由地用于学术,非营利和个人使用。所以说生信界的每个人都应该感谢他,不然咱现在分析数据都得花钱找Celera买啊!
Jim Kent 与David Haussler
完成了以上工作的大神还在博士学位攻读中,顺手又开发了BLAT和UCSC Genome Browser. 2002年才正式获得博士学位。这学位含金量妥妥24k的。但是大神本人很淡定,一块金也没有往脸上贴,人家是很温馨地介绍自己的:
I'm a research scientist at UCSC. I work primarily on web tools to help understand the human genome. Before becoming a bioinformatician I got a PhD in biology working with with the Zahler Lab. Before that I wrote computer art and animation programs. I live in Santa Cruz, CA and have three children, Mira, Tisa, and Maia.
这一听瞬间圈粉,始于颜值, 陷于才华, 忠于人品。最后薄荷姐来总结一下,Jim Kent能成为生信了不起的风云人物,可能因为拥有如下特质:编程快,算法优,执行力强,人品贵重,盛世美颜适合配搭各色帽子。
最后收工再送张男神自拍照,就酱。