线粒体DNA结构和组成
线粒体DNA的结构
线粒体的DNA(mitogenome)是独立于细胞核染色体之外的基因组,它具有独立的自我复制,转录和编码的功能。一般中的线粒体基因组较小,为10-39kb,酵母为8-80kb;都是环状;植物的线粒体基因组比动物的大许多,但也复杂的多,大小可以从200-2500kb。
以人的线粒体为例,有16,569bp组成,双链闭合的环状结构,其中外链DNA单链由于G多C少,使得整个外链的DNA分子量较大,陈伟重链(heavy chain)或者H链;内环的单链C含量高,G含量少,称为轻链(light chain)或者L链。
线粒体的基因组中没有内含子序列,编码的基因有重叠的现象。
线粒体DNA的组成
线粒体DNA有37个基因组成,其中包括两个rRNA基因(rrnL,rrnS),13个编码蛋白质的基因,还有22个tRNA基因。
这里着重说一下CO1基因吧,也写做COX1,这个基因由于具有物种特异性,又相对的比较保守,一般被用作barcode,用于鉴定物种。
![](http://n4.ikafan.com/assetsj/blank.gif)
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线粒体中还有一个D loop区域,这个区域没有编码区,也是变异最大的区域,这个区域我查了很多资料,都没有特别的结构上的定义,不过好在可以将组装好的线粒体基因组上传到MITOS2网站 http://mitos.bioinf.uni-leipzig.de/index.py,它可以帮你分析这个D loop 区域的范围。
Reference:
https://wenku.baidu.com/view/08f89178eef9aef8941ea76e58fafab068dc441c.html
https://baike.baidu.com/item/%E7%BA%BF%E7%B2%92%E4%BD%93DNA/4101125?fr=aladdin
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