最新研究：新型冠状病毒人传人平均间隔时间为7.5天
“平均潜伏期为5.2天，潜伏期分布情况的第95百分位数为12.5天。”
编译：步摇
本文来自《新英格兰医学杂志》3月26号发布的文章。
摘要
2019年12月和2020年1月，在中国湖北省武汉市出现了新型冠状病毒（2019-nCoV）感染肺炎（NCIP）的最初病例。我们分析了武汉最早的425例确诊病例的数据，以确定NCIP的流行病学特征。我们收集了截至2020年1月22日已报告的，经实验室确诊的NCIP病例的人口统计学特征、暴露史和疾病时间线的信息。我们描述了病例特征，并估计了关键流行病学延迟时间分布情况。在呈指数增长的初期，我们估计了传染病倍增时间和基本再生数。在最早的425例NCIP确诊患者中，中位年龄为59岁，56%为男性。
在2020年1月1日前发病的病例中，大部分（55%）与华南海鲜批发市场相关，而在此后发病的病例中，仅8.6%与华南海鲜批发市场相关。平均潜伏期为5.2天（95%置信区间[CI]，4.1~7.0），潜伏期分布情况的第95百分位数为12.5天。在初期，倍增时间为7.4天。由一人传至另一人的平均间隔时间（serial interval）为7.5天（95% CI，5.3~19），基本再生数估计为2.2（95% CI，1.4~3.9）。
根据这一信息，有证据表明，自2019年12月中旬以来，密切接触者之间已发生人际传播。如果其他地区的传播动力学也相似，我们将需要付出相当大的努力来减少传播，从而控制疫情，应在高危人群中采取预防或减少传播的措施。
自2019年12月以来，华中地区拥有1100万人口的大城市武汉发现了越来越多的新型冠状病毒（2019-nCoV）感染肺炎（NCIP）病例。2019年12月29日，当地医院运用“不明原因肺炎”监测机制，发现了最早报告的4个病例，这4例均与华南海鲜批发市场相关；上述监测机制是在2003年暴发严重急性呼吸系统综合征（SARS）疫情后建立，目的是尽早发现新型病原体（例如2019-nCoV）。最近几天，中国其他城市和全世界十几个国家都发现了感染病例。我们在本文中对武汉市最早的425例实验室确诊病例的数据进行了分析，从而描述NCIP的流行病学特征和传播动力学。
结果
在新型冠状病毒疫情发展过程中，病例数量呈指数增长，最近几天的曲线下降可能是由于近期发病的病例未得到充分确认，以及病例识别和报告时间的延迟，而非发病率的真正拐点（图1）。具体而言，曲线后半部分并不表示新发病例数量减少，而是由于截止日期前的病例确认有所延迟。随着时间的推移，检测试剂盒的供应和使用增多，因此1月份的病例数量增长速度应谨慎解读。大多数最早的病例均报告了华南海鲜批发市场暴露史，但从12月底开始，与该市场不相关的病例数量呈指数增长。
患者的中位年龄为59岁（范围，15~89岁），425例患者中有240例（56%）为男性。没有任何病例是15岁以下儿童。我们分析了三个时间段的病例特征：第一个时间段是1月1日（关闭华南海鲜批发市场的日期）前发病的患者；第二阶段是1月1日至1月11日（向武汉提供RT-PCR试剂的日期）期间发病的患者；第3个时间段是1月12日或之后发病的患者（表1）。发病较早的患者年龄略轻，男性比例较高，报告华南海鲜批发市场暴露史的比例明显较高。医务人员在病例中所占的比例在三个时间段逐步增加（表1）。
我们分析了10例确诊病例的暴露数据，估计平均潜伏期为5.2天（95%置信区间[CI]，4.1~7.0）；分布情况的第95百分位数为12.5天（95% CI，9.2~18）（图2A）。我们获得了5个病例集群的信息，见图3。根据这些集群中6对病例的发病日期，我们估计由一人传至另一人的平均（±SD）间隔时间分布情况为7.5±3.4天（95% CI，5.3~19）（图2B）。
在截至2020年1月4日的流行曲线中，传染病增长率为每天0.10（95% CI，0.050~0.16），倍增时间为7.4天（95% CI，4.2~14）。应用上述由一人传至另一人的间隔时间分布情况，我们估计R0为2.2（95% CI，1.4~3.9）。
在1月1日之前发病的45例患者中，从发病至首次就诊的平均间隔期估计为5.8天（95% CI，4.3~7.5），与1月1日至1月11日期间发病的207例患者的数据相似，后者的平均间隔期为4.6天（95% CI，4.1~5.1）（图2C）。在1月1日之前发病的44例患者中，从发病至住院的平均间隔期估计为12.5天（95% CI，10.3到~14.8），这一间隔期超过1月1日至1月11日期间发病的189例患者（均值，9.1天；95% CI，8.6~9.7）（图2D）。我们未绘制1月12日或之后发病患者的分布曲线，因为近期发病和发病与就诊之间的间隔期较长的患者尚未检测出。
讨论
我们估计R0约为2.2，这意味着每例患者平均将感染传给了另外2.2人。一般而言，只要R0大于1，疫情就会不断加剧，而疾病控制措施的目标是将再生数降低至1以下。SARS的R0估计为3，我们通过隔离患者和严格控制感染的方式成功控制了SARS疫情。控制NCIP疫情是面临的挑战包括明显存在许多轻度感染，以及可用于隔离病例和隔离观察密切接触者的资源有限。我们对R0的估计仅限于1月4日之前，因为近几周以来人们对疫情认识的增加及检测试剂盒供应和使用的增多将增加得到确认的感染比例。武汉随后采取的控制措施，以及近期中国其他地区和国外采取的控制措施有可能已经降低了传播率，但中国其他地区和全球检出病例数量的增多提示疫情规模继续扩大。武汉及周边城市从1月23日以来采取的封城措施应该可以减少病例向中国其他地区和国外的输出，而目前的当务之急是确定其他地区是否也发生了类似强度的本地传播。
值得关注的是，早期病例中儿童极少，425个病例中有近一半的年龄≥60岁，但我们的病例定义中规定病情严重到需要医疗，而病情可能因是否有并发症而存在差异。此外，儿童可能不易受到感染，而且即使感染，其症状也较轻，上述两种情况均可解释确诊病例中儿童比例较低的情况。第一波疫情后的血清学调查将阐明这一问题。已经有医务人员发生感染，其比例低于SARS和MERS疫情时的情况。
尽管发病与就诊之间的间隔期一般较短，有27%的患者在发病后2天内就诊，但发病与住院之间的间隔期却要长得多，有89%的患者至少要到发病第5日才住院（图2）。这表明在疾病早期很难识别和隔离病例。为了积极主动追查病例，可能有必要在门诊和急诊科投入大量资源检测患者，这既是在尚未发生本地传播的地区所采取的疾病遏制策略，也是为了更早地对病例采取临床治疗。该方法还将提供关于亚临床感染的重要信息，以便更好地评估严重程度。
总之，我们发现武汉现阶段的NCIP病例倍增时间约为7.4天。密切接触者之间的人际传播从12月中旬开始已经发生，并在此后一个月内逐渐播散。接下来的紧急工作包括确定可减少社区内传播的最有效控制措施。
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