纯生信单基因独立预后发文思路3+ 2024-04-23 04:15:27 研究背景:核糖核苷二磷酸还原酶亚基M2(RRM2)是核糖核苷酸还原酶的催化亚基,可调节酶活性,这对于DNA复制和修复至关重要。然而,RRM2在肺腺癌(LUAD)中的作用仍不清楚。研究方法:在这项研究中,我们探讨了TCGA,GEO,Oncomine,UALCAN,PrognoScan和 Kaplan-Meier Plotter在LUAD中RRM2的表达模式和预后价值,并通过Cox分析证实了其独立的预后价值。LinkedOmics和GEPIA2用于研究与RRM2相关的共表达和功能网络。此外,我们使用TIMER来评估RRM2与主要六种肿瘤浸润免疫细胞之间的相关性。最后,通过TIMER门户通过肿瘤纯度校正的部分Spearman秩相关系数,检查了免疫调节剂,趋化因子和28种肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)和RRM2的免疫特征之间的相关性。研究结果:在TCGA-LUAD的肿瘤组织中发现RRM2上调,并在多个独立队列中进行了验证。此外,无论是在TCGA还是其他队列中,均发现高RRM2表达与不良的生存率相关。Cox分析表明,高RRM2表达是LUAD总体生存,疾病特异性生存和无进展生存的独立危险因素。功能网络分析表明,RRM2通过涉及多种与癌症相关的激酶和E2F家族的途径来调节真核生物中的RNA转运,卵母细胞减数分裂,剪接体,核糖体生物发生以及细胞衰老信号传导。同样,RRM2表达与B细胞,CD4 + T细胞和嗜中性粒细胞的浸润水平相关。随后的分析发现,B细胞和树突状细胞可以预测LUAD的预后。通过Cox分析将B细胞确定为六种类型免疫细胞中的独立危险因素。最后,相关分析表明RRM2与我们进行的免疫标记的67.68%(624/922)相关。研究结论:我们的研究表明,RRM2可以独立预测LUAD的预后,并与免疫浸润有关。特别是,RRM2和B细胞标记基因之间的紧密关系是免疫反应的潜在中心,也是影响预后的关键因素之一。我们的发现为进一步研究RRM2在LUAD中的免疫调节作用奠定了基础。分析内容如下:1、对RRM2做差异分析,并在多个数据库中进行验证 2、RRM2表达与临床特征的相关性分析 3、生存分析 4、单因素、多因素Cox 回归分析 5、RRM2共表达分析、GO、KEGG分析 6、RRM2与免疫细胞的相关性分析 赞 (0) 相关推荐 毕业救星!6 生信SCI,一个数据库就搞定?没有比它更适合临床硕博毕业神器了吧? 分分钟搞定6分 单基因联合免疫浸润的预后套路生信文章 小伙伴们大家好,我是菠小萝.今天为大家复现一篇2020年10月发表在<Front Oncol>(影响因子:4.848)上的单基因联合免 ... 55天接收的准6分纯生信,想发文章并不难 大家好,今天要和大家分享的是2021年2月发表的一篇文章:"Comprehensive Analysis of the Immune and Prognostic Implication o ... 新颖的共刺激分子基因集2区5+分纯生信文章 导语 今天和大家分享的是2020年9月份发表在OncoImmunology杂志上的一篇文章(IF=5.889)"Identification of a costimulatory molec ... 肺腺癌中单基因(P2RY12)免疫微环境相关分析 题目:Prognostic value and immune infiltration of a novel stromal/immune score-related P2RY12 in lung a ... 一文带你学会如何通过多维度的分析来论证同一个假设 Multi-dimensional omics characterization in glioblastoma identifies the purity-associated pattern an ... 太太太太硬核了!5个数据库让你批量发5+SCI!难度不大,可复现性极强! 解螺旋公众号·陪伴你科研的第2612天 肝癌纯生信 大家好,我是Jerry,今天我给大家分享一篇单基因在肝癌疾病方面的纯生信文章,该文章是发表于Aging-US杂志上,最新影响因子为5.682分.该篇 ... 准7分,2个月接收的单基因生信+组化验证 可重复! 大家好,今天要和大家分享的是2021年4月发表的一篇文章:"CD2 Is a Novel Immune-Related Prognostic Biomarker of Invasive Br ... 最新7.5分SCI 单基因单肿瘤生信+简单实验 内质网氧化还原1样(ERO1L)基因编码一种与缺氧相关的内质网腔定位糖蛋白,其表达异常可产生过量的活性氧簇,从而激活细胞凋亡途径.本研究旨在讨论ERO1L在肺腺癌(LUAD)和肿瘤免疫微环境(TIME ... 单基因纯生信3.9分,两个月接收 前言 今天和大家分享的是2020年10月份发表在International Immunopharmacology杂志上的一篇文章(IF=3.9)"BICC1 as a novel progn ... 4+分的Aging现在得补这么多湿实验了! Elevated lymphocyte specific protein 1 expression is involved in the regulation of leukocyte migrati ... 5+肿瘤坏死因子家族预后模型构建 导语 今天跟大家分享的是2020年5月发表在Ebiomedicine(IF=5.736)杂志上的一篇文章:"Comprehensive molecular analyses of a TNF ... 8分+ 单基因干湿结合,非常规思路,值得学习 大家好,今天要和大家分享的是2021年6月23日发表的一篇文章:"YKT6,as a potential predictor of prognosis and immunotherapy r ... 又是一篇4+分免疫亚型...别撞车了... Identification of immune subtypes and prognosis of hepatocellular carcinoma based on immune checkpoi ... 7.2分基因家族单肿瘤分析,就这? 在本项研究中,作者使用多个公共数据库系统地探索和验证了TBC1D3家族在肾透明细胞癌(KIRC)中的表达水平和预后价值.此外,作者还研究了TBC1D3家族成员的功能以及TBC1D3家族表达与KIRC免 ... 肿瘤也有“冷”“热”之分?一篇简单易上手的5分纯生信文章,包你稳赚不赔 小编又发现一篇简单易上手的生信文,标题为"A Novel Immune-Related Prognostic Model for Response to Immunotherapy and ... 5.2分SCI 单基因生信+组化验证 本研究作者旨在探讨钙结合蛋白家族成员S100A16在胰腺癌(pancreatic cancer , PC)中的表达和预后价值评估.首先利用Oncomine检测S100A16在PC等肿瘤中的表达水平及预 ...