日问24:你眼中的臭,到底有多香?细品《NEJM》新冠病毒传播动力学文章

首先声明个人立场:
“集体领导、民主集中、个别酝酿、会议决定”是一贯原则,任何重大事件决策都不是个人行为。
某人或者某单位是否存在渎职行为,舆论可以监督,但取决于组织调查,不多评论。
研究成果的迅速产生不是坏事情,反而更利于全世界去重视疫情,提高警惕,出谋划策。
决策不利,损伤重大,但科学无罪。
上帝的归上帝,凯撒的归凯撒。
好,言归正传,来看看关于“新冠”的最新重磅研究给了我们哪些启示:
一、数据的来源;
最早的病例是通过“不明原因肺炎”监测机制发现
不明原因肺炎的定义:
未发现病原体的疾病;发热(≥38°C),有肺炎的影像学证据,白细胞计数低或正常或者淋巴细胞计数低,按照标准临床指南给予抗菌治疗3~5天后症状无改善。
识别潜在病例方法:
现场调查,收集呼吸道标本,集中检测。
重要的流行病学数据:
每例感染患者及其亲属的暴露史,包括暴露于任何野生动物的日期、时间、频率和模式,以及任何相关环境的暴露史,事件时间线,密切接触者
二、病例定义;
疑似病例标准的一次调整:
2020年1月18日之前:符合前三条标准并且与华南海鲜批发市场有流行病学关联或者接触过其他类似症状患者的肺炎病例:发热(有或无体温记录);有肺炎的影像学证据;白细胞计数低或正常或者淋巴细胞计数低;按照标准临床指南给予抗菌治疗3天后症状未减轻。
2020年1月18日之后 在发病前14天内曾到武汉旅行或与来自武汉且有发热或呼吸道症状的患者直接接触
确诊病例:
三种方法中的至少一种:
分离出2019-nCoV,
实时逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)至少有两次显示2019-nCoV阳性,
检测出与2019-nCoV匹配的基因序列。
实验室检查
取患者上、下呼吸道标本。提取RNA,使用2019-nCo特异性引物和探针进行实时RT-PCR检测。检测分别在湖北省CDC和中国CDC病毒病预防控制所的生物安全二级实验室中进行

三、统计学分析
(1)根据发病日期构建传染曲线,
(2)使用对数正态分布拟合暴露史和发病日期数据,估计了潜伏期
(3)使用Weibull分布估计了从发病至首次就诊的间隔期和从发病至住院的间隔期
(4)使用伽马分布估计了由一人传至另一人的间隔时间
(5)通过分析12月10日至1月4日期间发病病例的数据来估计传染病增长率,为我们预计在12月13日武汉正式宣布疫情爆发后不久,确诊的感染比例会增加
(6)拟合了一个人畜共患传染病传播模型, 并利用这一模型得出了传染病增长率、传染病倍增时间和基本再生数(R0)
四、结果
(1)在新型冠状病毒疫情发展过程中,病例数量呈指数增长,
(2)最近几天的曲线下降可能是由于近期发病的病例未得到充分确认,以及病例识别和报告时间的延迟,而非发病率的真正拐点
(3)随着时间的推移,检测试剂盒的供应和使用增多,因此1月份的病例数量增长速度应谨慎解读
(4)大多数最早的病例均报告了华南海鲜批发市场暴露史,但从12月底开始,与该市场不相关的病例数量呈指数增长。
(5)患者的中位年龄为59岁(范围,15~89岁),425例患者中有240例(56%)为男性。没有任何病例是15岁以下儿童(后来疫情发展证实也可传播儿童)。
(6)发病较早的患者年龄略轻,男性比例较高,报告华南海鲜批发市场暴露史的比例明显较高。
(7)医务人员在病例中所占的比例在三个时间段逐步增加(人传人的重要证据,钟南山院士的“肯定人传人”的底气)

(8)估计平均潜伏期为5.2天(95%置信区间[CI],4.1~7.0);分布情况的第95百分位数为12.5天(95% CI,9.2~18)(隔离观察14天的来源)
(9)估计由一人传至另一人的平均(±SD)间隔时间分布情况为7.5±3.4天(95% CI,5.3~19)
(10)传染病增长率为每天0.10(95% CI,0.050~0.16),倍增时间为7.4天(95% CI,4.2~14)。
(11)R0为2.2(95% CI,1.4~3.9)这意味着每例患者平均将感染传给了另外2.2人(低于国外的数学模型推算的3.8)
(12)从发病至首次就诊的平均间隔期估计为5.8天(95% CI,4.3~7.5),与1月1日至1月11日期间发病的207例患者的数据相似,后者的平均间隔期为4.6天(95% CI,4.1~5.1)(图2C)。
(12)在1月1日之前发病的44例患者中,从发病至住院的平均间隔期估计为12.5天(95% CI,10.3到~14.8),这一间隔期超过1月1日至1月11日期间发病的189例患者(均值,9.1天;95% CI,8.6~9.7)(图2D)。我们未绘制1月12日或之后发病患者的分布曲线,因为近期发病和发病与就诊之间的间隔期较长的患者尚未检测出。(数据有利于医疗保障能力配备需求评估)

五、讨论及展望

1)密切接触者之间的人际传播从12月中旬开始已经发生,并在此后一个月内逐渐播散。
(2)接下来的紧急工作包括确定可减少社区内传播的最有效控制措施。
(3)目前采用的病例定义可能需要作出修订。
(4)监测病例特征,从而发现流行病学变化,例如在较小年龄人群或医务人员中发生的感染增多。
(5)流行动力学的预测,以及对家庭内或其他地区人际传播情况开展的研究,
(6)确定亚临床感染发病率的血清学调查也将很有意义

科研很重要,因为只有科研才能客观地告诉你
已经发生了什么?
为什么会发生?
将发生什么?
能做些什么?

书读的多了,膝盖应该更硬
希望科研工作者们在舆论面前继续站着,在权力面前也别跪着
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