MEGAN 6.18 重大更新,你还在看老教程?

megan中文教程也网上有很多,现在随着megan的更新,统统都歇下了。不得不说发展真快。
旧的数据库不可用这里也推荐大家使用新的数据库吧,新的megan安装需要跟新java,我在操作后也成功在ubuntu上安装好megan6.18版本,数据库也是用的最新的合并库,使用-mdb调用,但是这里缺乏kegg数据库,我们需要手动下载一个基因号和kegg对应的table指定就可以了。
 megan6的blast2lca命令已经不可用了,意味着物种注释命令在megan中消失了,开发者讨论过这个工具对结果的重现性不好。这也就是说daa2rma包揽了全部功能,提取rma文件信息使用rmainfo。
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