MET异常NSCLC的基因异质性和免疫治疗的临床疗效

德国科隆大学医院的A. Kron博士等用二代DNA测序方法(AmpliSeq或GeneRead)检测了337例MET异常而且EGFR阴性IIIB/IV期NSCLC的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本,并用荧光原位杂交(FISH)法检测了其中275例的MET扩增和RET/ROS1/ALK融合,用免疫组化(IHC)检测了其中227例的PD-L1表达。

※基因检测结果

MET 14 外显子跳跃突变59例(17.5%),其中19例伴随MET扩增。MET扩增在本研究中的阈值标准为MET/CEP7(MET拷贝数与7号染色体着丝粒数的比值)≥2.0或MET基因拷贝数(GCN)≥6。MET扩增278例(不包括MET突变组中的伴随MET扩增患者),根据MET基因拷贝数(GCN)不同分成三组:MET低水平扩增组(GCN<4)138例,MET中水平扩增组(GCN=4~5)24例,MET高水平扩增组则包括三类,MET/CEP7≥2.0而且GCN<6有31例,GCN=6~9有41例,GCN≥10有34例。

MET14外显子跳跃突变患者有共存基因突变的比例明显低于MET扩增患者,42.4% vs 87.1%,p<0.001。所有患者EGFR/ROS1/ ALK均为阴性。12例BRAF突变,其中2例V600E突变合并MET低水平扩增,其余10例均为Ⅱ类BRAF突变(详见前文《 BRAF 突变 NSCLC 的分子景观和可靶向的非 V600 驱动突变》 )。最常见的共存突变基因为TP53(57.8%)、KRAS(30.9%)和KEAP1(15.1%),在MET扩增患者中的比例显著高于MET突变患者,分别为62.9% vs. 33.9%,36.7% vs. 3.9%和17.6% vs. 2.3%。

在MET 扩增患者中,随着扩增水平的增高,TP53 和KRAS 突变的共存比例随之降低,而KEAP1 突变反之,但大多数KEAP1 突变无功能性。

79例(34.8%)的患者PD_L1表达≥50%,MET突变和扩增之间没有显著性差异,不同扩增水平患者间也没有显著性差异。

免疫治疗的临床疗效

随访时间34 个月,获得319 例患者的总生存期数据,其中MET 14 外显子跳跃突变56 例,中位总生存期12.0 月,MET 扩增263 例(30 例GCN ≥10 ,中位总生存期10.0 月;233 例GCN<10 ,中位总生存期4.0 月)。

120例患者接受了免疫治疗,其中MET 14外显子跳跃突变组22例,MET 扩增组98例。

MET 扩增组中,免疫治疗大多数为二线单药,相对没有接受免疫治疗的患者总生存期显著延长,GCN<10 :19.0 月vs. 8.0 月,GCN ≥10 :6.0 月vs. 4.0 月。

MET 14 外显子跳跃突变组中,接受免疫治疗的患者总生存期长于没有接受免疫治疗的患者,16.0 月vs. 10.0 月,但没有显著性差异。

没有发现PD_L1表达对免疫治疗疗效的显著影响。

结果讨论

(1 )本研究发现MET 14 外显子跳跃突变患者有共存基因突变的比例明显低于MET 扩增患者,进一步确认了它是真正的驱动基因。

(2 )MET 14 外显子跳跃突变患者的肿瘤突变负荷(TMB )较低,本研究的结果和其它研究一致,免疫治疗的获益可能性小。

(3 )不论扩增水平高低,接受免疫治疗的MET 扩增患者的中位总生存期显著长于没有接受免疫治疗的患者。

原始文献:

DOI: 10.1016/j.jtho.2020.11.017

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