推荐：江舜尧
编译：陈佩佩
编辑：十九
美国犹他大学生物科学系Rodolfo Martínez-Mota1教授等人于2019年9月9日在环境科学与生态学顶级期刊The ISME Journal在线发表题为《Natural diets promote retention of the native gut microbiota in captive rodents》的研究成果，该研究成果揭示了用天然食物补充圈养啮齿类动物饮食的重要性，以维持为科学或以保护目的而在人工条件下饲养的动物的原生肠道微生物群落。
文章摘要
圈养后，野生动物的肠道微生物组随着生活方式改变而改变。然而，对于促使肠道微生物群落在圈养状态下发生改变的因素以及采取何种措施可以缓解微生物的变化却知之甚少。研究者将捕捉到的野生白喉林鼠(Neotoma albigula)带到实验室条件下，探究其在圈养环境中提供天然饲料是否有利于其体内原生微生物群落的保留。在三周的时间里，喂养白喉林鼠两种不同的食物：野生采集的仙人掌和商业加工的人工食品。采用Illumina 16S rRNA 测序，对比捕获时和圈养三周后白喉林鼠粪便微生物的变化。实验结果发现，提供野生天然饮食的白喉林鼠显著减少了它们微生物群的变化，保留了它们在捕获时90%的肠道微生物群。然而，人工饲料喂养的白喉林鼠显著影响其肠道微生物的结构，丢失了38%的天然微生物。进一步研究发现，摄食人工饲料的白喉林鼠个体中，包括双歧杆菌（Bifidobacterium）和变形杆菌（Allobaculum）在内的核心细菌数量减少，与草酸盐降解相关的微生物丰度降低。因此，对于有科研价值或者需保护的野生动物在人工条件下饲养时，喂养天然食物而非人工食品有利于保护动物肠道微生物的原始状态。
文章中重要图片说明
图1 | 圈养白喉林鼠的微生物群落的变化与天然和人工饲料摄入量有关
图2| 野生与天然(b)和人工饲料(c)之间的微生物门(a)和对微生物群落差异贡献最大的科的相对丰度波动
图3 | 与采食野生、天然和人工饲料相关的核心微生物OTUs的对数丰度变化
图4 | 以野生条件为最可能来源的圈养白喉林鼠的微生物群落比例
你可能还喜欢
科研 | Science：描述健康和受损肠道微生物群发展的协变生态群稀疏网络
Genome Biology | 恒河猴幼崽肠道微生物群的成熟及其在腹泻病发生中的作用
这些或许也适合你哦👇
生物信息零基础培训班（北京；9月25-29日）
SCI论文图表+插图四天一晚高强度特训班（广州；2019年9月26-29日）
