Nature Microbiology | 核心肠道菌群是通过有益的相互作用和鱼类的菌株变异来维持的

推荐:江舜尧

编译:罗睺

编辑:十九

以色列别尔谢瓦内格夫本-古里安大学生命科学系 Itzhak Mizrahi 等人于2019年9月23日在Nature Microbiology发表了题目为《Core gut microbial communities are maintained by beneficial interactions and strain variability in fish》文章。该文章以鱼的肠道为模型(欧洲海鲈),旨在确定这种广泛分布于多种生境和环境条件下的核心肠道菌群,并阐明其持久性存在模式得以实现的机制。结果表明,这些核心微生物的持久性和共存性是通过低竞争、协同作用以及种内菌株变异性来维持的。

文章摘要

“核心肠道菌群”这个术语描述的是在特定栖息地持续存在的微生物。如果栖息地的条件变化很大,核心微生物也可以被认为是具有生态普适性。然而,关于代谢竞争和微生物相互作用是否影响一些微生物在核心微生物群中存活的能力,而另一些则不能,研究者对此知之甚少。作者在四种饮食条件下,对欧洲鲈鱼肠道内的三个部位的微生物群落进行了研究。在每一个肠道部位都发现了多种类的核心微生物群,它们在多种饮食鱼类中共享,并随着时间的推移而持续存在。研究者发现,核心微生物在共培养中往往表现出协同生长,并且预测和验证的代谢竞争水平较低。在核心微生物物种中,作者发现了高水平的种内变异性和菌株特有的栖息地专门化。种内变异和种间促进作用都可能有助于动物核心微生物群的生态稳定性。

文中重要图片说明

图1:通过肠道部分对生境进行过滤,形成了海鲈肠道微生物群落。

图2:由8个物种组成的核心肠道菌群持续存在于不同的饮食和肠道部位的栖息地,以及不同种类的鱼类中。

图3:在已确认的核心微生物之间普遍存在促进作用和正相互作用。

图4:核心物种表现出更高的菌株变异性,这与它们的栖息地适应性一致




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