纯生信发文的新技能,同一份GEO数据可以发两篇SCI!
为什么有些人总是能发好几篇纯生信SCI?因为人家掌握了方法,例如利用同一份GEO数据可以发两篇SCI,具体操作如下:
第一篇纯生信SCI可以这样做:
第一步,数据下载处理、合并、矫正、差异分析
第二步,进行WGCNA分析
第三步,进行取交集的基因
第四步,进行GO、KEGG富集分析、PPI分析、构建miRNA-mRNA-TF网络
第五步,进行免疫相关的分析
第二篇纯生信SCI可以这样做:
第一步,数据下载处理、合并、矫正、差异分析
第二步,重点关注免疫分析部分,不做其他分析,CIBERSORT这种算法估计审稿人都看腻了,我们使用ssGSEA算法计算免疫评分,并且分为免疫细胞和免疫功能这两部分
第三步,进行免疫细胞之间的相关性分析、免疫功能之间的相关性分析
第四步,进行正常组与疾病组之间免疫评分的差异分析
第五步,进行显著表达的基因与免疫细胞、免疫功能的相关性分析,并且筛选与免疫最为相关的基因(重点分析内容)
第六步,选出与免疫最为相关的基因构建模型(重点分析内容)
第七步,GO与KEGG分析估计审稿人都看腻了,我们来做一下DO分析
根据上面的操作就可以轻松得到了两篇纯生信SCI,只要你掌握了学习方法一样可以做到,那怕你从来都没有接触过纯生信。
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