代谢组检测平台怎么选择?

目前代谢组主要有以下三种检测方法:液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)、气相色谱-质谱联用技术(GC-MS)、核磁共振技术(NMR)。可以根据经费、物质性质、实验、样本类型、研究目的等方面,综合考量平台。

由于代谢物种类多,浓度差异大,往往更适合使用高分辨率、高灵敏度、高通量的质谱检测平台。质谱平台的选择一般可根据检测代谢物的类型和理化性质,选择不同的电离模式和质量分析器,从最大限度的获取代谢物信息。而NMR平台由于灵敏度较低,鉴定的物质比较少,应用并不广泛。当然,目前任何一种平台都没法覆盖全部的代谢物。

从经费角度来看,经费充足情况下,建议GC-MS和LC-MS都做,一般两种方法检测到的物质会有部分重合。GC-MS运行成本低于LC-MS。

从物质鉴定数量角度来看,一般更建议使用LC-MS平台。在做非靶向代谢时,由于LC-MS前处理简单,无需衍生化处理,通常鉴定到物质种类数更多,应用更广泛。

从重复性角度来看,GC-MS结果的重复性较差,衍生化处理将增加样品的不稳定性,导致重复性较差。

从物质性质角度来看,待测的代谢物分子量比较小或者关注挥发性物质时,可以选择GC-MS平台。

从样本类型角度来看,植物、土壤样品,可考虑用GC-MS,这与检测物质类型多为挥发性物质有关;液体或动物组织(包括人临床样品)多用LC-MC,一方面因为样品中的待测物质成分复杂,而LC-MS 适用性广,能全面覆盖到;另一方面LC-MS灵敏度高,能检测到更多物质。

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