Pubmed检索攻略大全(一)

引言:pubmed是大家最爱用的文献检索网站了,喝水不忘挖井人,pubmed就由美国国立医学图书馆下属的美国生物技术信息中心研制的基于Web的文献数据库,收录全世界包括美国在内80多个国家的5000多种生物医学期刊的文摘及题录数据。在后面的日子里,我们会一点点仔细来讲pubmed的一些用法。科研高手请绕道哈,我们这是写给刚入门的小白们看的。今天讲4个知识点,检索人名、检索期刊名、单篇引文匹配器以及检索临床研究。

如何检索人名?

检索格式:姓(last name, 全称),名(initials,单字母缩写)。

如检索“Watson JD”,以此格式进行名字的检索,PubMed会自动地将其识别为作者名(author field)检索。问大家一个问题,如果作者叫Bonnie W. Ramsey,检索框里面应该写什么呢?对的,检索Ramsey BW.

如果检索作者的全名,Bonnie W. Ramsey,大家可以试试看,会少很多文献,可能的原因是2002年之前的很多文献里没有提供作者的名字全称。

如果你只知道作者的名字的一半,比如只知道Watson,那么可以直接检索Watson [au],或者用advanced search,就是大家最爱用的高级检索。

如果作者的名字包含了“禁用词”,挺多的,有下面这张大表。

挺多的,看得眼花,也没有必要了解那么多,所以出个主意,如果只知道作者名字的一半,本来就会检索出来好多好多结果,也不用管作者名字是不是包含停用词了,直接再加一个检索条件。比如Smith是研究抽经的,那么再加上检索词。

比如:这样检索有7万多个结果,没法用。

加上其他检索词seizure,一下子缩减了很多。

如何检索期刊名?

这个很简单,输入期刊的全称或者缩写,比如输入“molecular biology of the cell”或“Mol BiolCell”

但是我们不太会为了找某本杂志的所有文献,如果要找到某本杂志的某个领域的,比如关于drosophila,可以用advanced search检索,或者直接在检索框里检索,两组检索结果差不多。

如何用单篇引文匹配器?

如果说我知道一篇文章的作者名,杂志名,以及发表的年限,如何快速地找到文献?可以试试single citation matcher,翻译过来可以理解为单篇引文匹配器。

是否能单独检索临床研究?

如上图,在pubmed的首页可以看到“clinical queries”,点击进去如下图,有三大块,clinical study, systematicreviews和medical genetic rearch,三大板块的含义解说如下图。

比如我随便检索一个breast cancer,检索后会有很多下拉菜单可以选择进一步的检索策略,比如是关于诊断、治疗、还是预后等等。第二个是系统评价的文章,如果是想检索此类文献,下次可以这样检索了,直接出来结果,这里显示关于breast cancer的系统评价有7000多篇。

好了,今天先策到这里,后天我们再继续讲pubmed的检索策略,希望对大家有帮助。

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