lncRNA的主要研究思路

长链非编码RNA（long non-coding RNA，LncRNA）一般指不具有蛋白编码能力，转录本长度超过200 nt的RNA分子，包括intronic/exonic lncRNAs、antisense lncRNAs、overlapping lncRNA和long intergenic ncRNAs（lincRNAs）。LncRNA与细胞周期和分化、发育、生殖、性别调控、衰老以及多种人类疾病密切相关。

lncRNA数量比较多，大约是为mRNA的3-100倍，但是目前多数lncRNA的功能仍不清楚，有很大的研究空间。最近，有文章报道lncRNA可以编码微肽并具有特定生物学功能，又拓展了新的研究方向。因此，lncRNA是目前生物和医学研究中的热点话题之一

高通量研究lncRNA主要思路

1. 利用组学研究LncRNA时空表达模式

   包括不同发育阶段、疾病发展进程等生物学连续过程中的lncRNA的种类、数量和表达丰度。

2. 候选lncRNA的功能研究

高通量筛选出对照组/处理组、处理不同时间点间以及其它生物学相关差异候选lncRNA，再进行后续功能学研究或作为疾病治疗靶点和biomarker研究。

3. LncRNA-mRNA或LncRNA-lncRNA interaction调控生物学功能研究

例如利用Genome-scale RNA interactome analysis（RIA-Seq）分析到TINCR lncRNA与多种mRNA结合调控细胞发育

4. miRNA-dependent CeRNA研究（转录组层面）。

5. LncRNA的多组学研究（基因组、转录组、表观组学等多层面）。

6. LncRNA编码肽段的研究

高通量预测组学lncRNA数据的蛋白编码能力，生信分析流程中保留可以编码的lncRNA进行后续研究。