生信工作资讯速递-JITRI医学免疫技术研究所

上一期见:生信工作资讯速递-中国科学院分子细胞科学卓越创新中心石建涛老师实验室的生物信息博士后招纳

又到了N周一更的生信工作咨询了,今天要介绍的岗位来自于江苏省产业技术研究院医学免疫技术研究所——JITRI医学免疫技术研究所(集萃免疫),目前全国最大的免疫组学研究中心。JITRI是江苏省产业技术研究院的简称(Jiangsu Industrial Technology Research institute)。

这是研究所所在的南京生物医药谷

看到这里,就这?省产业技术研究院?生物医药谷?不是和经常骚扰我们研究生办公室的生物公司差不多吗?

那自然是不可能的啦,那么现在,就要来一些有料的信息了。

研究团队

研究所所长:韩建博士

作为免疫组库二代测序技术的开拓者之一,韩健博士曾获得该领域全球首个技术专利。他研发的全自动封闭免疫组二代测序服务平台,极大地降低了免疫组测序实验的场地要求和人员要求,提升了安全性,使得免疫组测序走进医院的普通科室成为可能。他是免疫组万人测序项目的全球发起人,也是免疫组学全球行业会议的组织者之一。

在03年的抗击非典的战役中,韩健博士研发的快速分子鉴别诊断平台诊断了千余例非典病人,对疾病的诊断和控制做出了重大的贡献。

此外,强大的科学顾问团队也告诉我们,该公司并不简单。

何为免疫组?

该研究所的重点研发方向是医学免疫领域的精准诊断和个性化治疗,同时拥有一系列自主知识产权的免疫诊疗技术及产品。其中最引起我们生信认关注的是,她是目前全国最大的免疫组学研究中心。

嗯嗯,没错,又是组学,免疫组是继小编我在听到病毒组之后更为罕见的一种组学了。

和其他组学一样,免疫组学具有宏观掌控的作用,能将免疫系统作为一个整体进行观察并将其表征为动态模型的能力,它揭示了免疫系统的一些特征,以及其组成细胞的变化和运动状态。

组学有几样必要的元素:尽可能完善的组库、可供特异性识别的标志以及针对这些标志物的测序手段。

在免疫组之中:

1.免疫组库为特定时间段,机体所有有功能的T细胞和B细胞的总和。

2.免疫组库测序(Immune Repertoire sequencing)是以T/B细胞受体TCR为研究目标,通过多重PCR或5’RACE技术特异性扩增T/B淋巴细胞受体的TCR/BCR受体多样性的互补决定区(CDR3区),来评估免疫系统的多样性。

这边需要对CDR3区作为免疫组的特异性识别物做一个小小的知识补充。在人体的适应性免疫系统中,主要依靠与T淋巴细胞和B淋巴基本表面上的TCR和BCR等细胞受体,其受体上的互补决定区(CDR)与MHC-抗原肽分子进行识别并特异性结合。互补决定区V基因上的互补决定区由CDR1、CDR2、CDR3组成。其中,CDR1和2都是由V基因编码,而CDR3,由V、D、J三个基因编码形成,多样性最高,是主要的抗原识别区域。若检测到某一个TCR V家族CDR3区的克隆化改变,就标志着T细胞对某一抗原发生了特异性应答。

下图中淡蓝色淡就是CDR区域啦。

这图是wiki百科上的,所以:Based on Antibody_je2.neutral.svg  by Roland Geider (Ogre ), original PNG version by Je at uwo  on en.wikipedia

而目前随着人类基因组计划的完成,免疫组学的概念已远远超出了抗体和TCR的范畴,其新定义是研究免疫相关的全套分子库,它们的作用靶分子及其功能。

如果想进一步深入了解免疫组,可以看看生信技能树的教程:使用IMonitor进行免疫组库分析

同时,希望以下资料对您有帮助:

wiki百科上提供的免疫组databases

人类免疫基因组计划:http://www.immgen.org/index_content.html

用于精准化医学研究的人类免疫组学在线图谱:doi10.1038/s41587-020-0532-1

发表在Cell上的免疫组学研究doi: 10.1016/j.celrep.2018.09.021.

技术平台情况

研究所拥有目前中国最大的免疫基因组服务平台,配备全自动免疫组二代测序设备40余台,年生产量可达3万人次。全国首家提供单次反应中完成TCR/BCR 全部7条肽链的免疫组建库分析服务,检测范围覆盖全部CDR区(CDR1+CDR2+CDR3),涵盖了癌症免疫治疗、抗体药物研发、疫苗评估、感染性疾病及自身免疫性疾病诊疗和中医药现代化服务等领域,已和以下多家高校院所及科研机构开展了技术合作。

同时,在疫情期间,他们的技术有了充足的发挥空间。韩健博士及其团队在2012年发现了一种可以从疾病康复的患者体内分离出一种病原体感染特异性抗体的方法。这项技术被钟南山院士建立的中国广州呼吸疾病国家重点实验室的实验室主任陈凌教授所认可,几年前开始,陈凌教授就已经把该技术应用于开发疫苗来对抗流感和寨卡病毒。面对目前严峻的疫情,陈教授实验室已经运用该技术迅速地开发针对新型肺炎的治疗性疫苗。

需要怎样的你

生信工程师-免疫组库方向
生物信息工程师岗位职责:

1、 与生产部交接,管理项目相关的测序结果数据;

2、 开发内部生物信息分析工具;

3、 分析项目相关的结果数据,绘制图表并编写分析报告;

4、 与产品部交接,讲解项目分析结果的要点;

5、 协助甲方撰写与生物信息学分析相关的说明文字。

任职资格要求:

1、 生物信息学专业硕士学历及以上,具有科研项目参与经历或曾发表研究论文者优先;

2、 熟悉Linux系统的操作,Perl/Python/R等脚本语言至少熟练掌握1种;

3、 英文阅读和写作能力突出者优先。

你会得到什么

1. 薪资待遇:年薪25-35万之间

2. 公司福利:全额五险一金、带薪年度休假、专业入职培训、丰厚绩效奖金、多彩团队活动、丰富节日福利、职业进阶机制、大咖学术交流。

如何申请

投递简历至:xieying@aaii.org.cn ,同时抄送给生信技能树创始人jimmy( jmzeng1314@163.com)

邮件标题为:应聘岗位-地点-姓名

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