生命新知·情报丨科学家发现骨关节炎新基因位点

从父亲遗传的结构变异增加自闭症风险

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近年来，研究人员已经确定，第一次出现的基因突变——称为“从头突变”（de novo mutations），在自闭症谱系障碍（ASD）病例中约占四分之一。在一项新的研究中，由美国加州大学圣地亚哥分校的科学家领导的一个国际研究小组发现了一个新的罪魁祸首，这个罪魁祸首或可解释一些剩余的风险：非编码DNA区域中罕见的遗传变异。

研究人员对2600个受ASD影响的家庭的9274名受试者的全基因组的自然选择和分离畸变（transmission distortion）的证据进行了调查。在一个829个家庭的发现队列中，在启动子和未翻译的区域内，结构变异体被耗尽，且父亲遗传的顺式调控元件结构变异（CRE-SVs）优先地传给受影响的后代，而不是其未受影响的兄弟姐妹。罕见的可遗传的非编码变异使儿童易受患ASD，父亲和母亲的贡献各不相同。

Science 2018;360:327-331

脊椎动物RNA病毒的进化史

中国疾病预防控制中心传染病预防控制所张永振研究团队使用大规模的Meta转录组方法开展了一项研究，在爬行动物、两栖动物、肺鱼、辐鳍鱼、软骨鱼和无颚鱼中发现了214种与脊椎动物相关的病毒。新发现的病毒出现在与脊椎动物感染相关的RNA病毒的每一个家族或属中，包括了含有人类病原体的病毒，如流感病毒、沙粒病毒和丝状病毒家族，它们的分支顺序广泛反映了其宿主的系统发育史。该研究为大多数脊椎动物RNA病毒建立了长期的进化史，并使用直系同源内源病毒元件来评估进化时间尺度（evolutionary timescales），以支持这一观点。该研究还鉴定了新的脊椎动物特有的RNA病毒和基因组结构，并重新评估了媒传RNA病毒（vector-borne RNA viruses）的进化。

综上所述，这项研究揭示了脊椎动物整个进化史中多样的病毒-宿主关联。

Nature 2018;556:197-202

科学家发现骨关节炎新基因位点

骨关节炎的遗传可能性约为50%，既往的遗传学研究共鉴定了21个位点。英国谢菲尔德大学的Eleni Zengini等人进行了一项大型骨关节炎全基因组关联研究（genome-wide association study，GWAS），使用了来自英国Biobank的1650万个变异的数据。在对30727例病例和297191例对照进行再验证研究和荟萃分析后，该研究团队发现了9个新的骨关节炎位点，其中最有可能的具有因果关系的变异是非编码变异。该研究建立了骨关节炎与高体重指数的因果关系，但未发现骨关节炎与甘油三酯水平或2型糖尿病的遗传易感性之间存在因果关系。

在未来，大规模的全基因组测序研究应针对不同人群中表型良好的个体，并捕获完整的等位基因频率和变异类型谱，并进一步探究这种疾病的病因。

Nat Genet 2018;50:549-558