非肿瘤纯GEO数据挖掘好发爆

1、在GEO数据库找到相关的数据集,然后下载下来

2、做差异分析,得到差异基因(热图、火山图可有可无,这篇文章就没有)

3、对多个数据集的差异基因取交集,如下图

4、对差异基因做GO富集分析

5、对差异基因做pathway富集分析

6、PPI分析

这篇文章题目:Identification of differentially expressed genes in synovial tissue of rheumatoid arthritis and osteoarthritis in patients

(DOI: 10.1002/jcb.27741)

其实,不用编程完全可以完成上面的分析,这样的文章说夸张点一顿饭的时间就搞定了。

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