Psychological Medicine | 宏基因组学揭示了严重抑郁症患者肠道微生物群的分类和色氨酸途径差异(国人作品)
推荐：江舜尧
编译：艾奥里亚
编辑：小菌菌
深圳心理健康中心，深圳市康宁医院的荣晗，谢新晖等人于2019年11月5日在Psychological Medicine上发表题目为《Shotgun metagenomics reveals both taxonomic and tryptophan pathway differences of gut microbiota in major depressive disorder patients》的文章。肠道微生物与全身疾病息息相关，基于之前的研究发现，在精神障碍患者的肠道微生物的组成和功能存在失衡。此外，色氨酸（TRP）相关通路被认为在神经传递、免疫稳态和肠脑信号传导中起着至关重要的作用。基于一系类前人的研究基础，笔者假设，与健康对照组（HCs）相比，MDD患者的肠道微生物菌群存在差异，同时，TRP合成和代谢相关基因的低丰度可能与抑郁症状严重程度有关。基于宏基因组测序，笔者发现，肠道微生物菌群和相关的肠道MiTBamp可能参与MDD的发病机制，除此之外，特定属的相对丰度可能具有成为MDD生物标志物的潜力。本研究结果为人们能够更好地了解MDD患者肠道微生物群的变化和相关的TRP途径提供数据支撑。
文章内容
微生物-肠-脑轴，特别是微生物色氨酸（Trp）生物合成和代谢途径（MiTBamp），可能在抑郁症（MDD）的发病机制中起关键作用。然而，对MDD中有关Mitbamp的研究还较少。本研究通过对26例MDD患者和29例健康对照（HCs）的粪便样本进行了鸟枪法宏基因组测序，对患者和对照人群的肠道微生物群落进行比对并对MiTBamp进行分析。同时，建立了基于随机森林（RF）和Boruta算法的分类，以确定肠道微生物作为MDD的生物标志物，意在明确MDD患者的肠道微生物组成和MiTBamp。通过研究发现，与HCs患者肠道微生物丰度相比，MDD患者Bacteroidetes的丰度显著降低，而Actinobacteria丰度显著增加。最值得注意的是，MDD患者增加了益生菌Bifidobacterium的水平。包括K01817，K11358，K01626，K01667在内的4个KOs（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes orthologies）的丰度在MDD患者的MiTBamp中较低。此外，我们发现MDD组的K01626丰度与HAMD评分呈负相关关系。综上，本研究结果使人们能够更好地了解MDD患者肠道微生物群的变化和相关的TRP途径。肠道微生物菌群的改变可能具有作为HCs转变为MDD患者的生物标志物的潜力。
